RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D16Q8TBP0 767 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC114Q96M63 670 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 MS4A10Q96PG2 267 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 MTRRQ9UBK8 725 aa7.62□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM64BA6NI03 449 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMD14O00487 310 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 HS3ST1O14792 307 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 NDUFS7O75251 213 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 DDNO94850 711 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP1A2P05177 515 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 OR52Z1P0C646 297 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 UGT1A1P22309 533 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TAS2R38P59533 333 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ZXDAP98168 799 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2V1Q13404 147 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBB2AQ13885 445 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 NFE2L1Q14494 772 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRCAPQ14761 206 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 MFN1Q8IWA4 741 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 EMC1Q8N766 993 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SEMA3CQ99985 751 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 PADI3Q9ULW8 664 aa7.61□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0U1RQK1 487 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF320A2RRD8 509 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 H0YGN5 161 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 J3QR06 171 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 GABRA5P31644 462 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 GDF5P43026 501 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ENTPD1P49961 510 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 RBPJQ06330 500 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ACSM1Q08AH1 577 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 PTK6Q13882 451 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 MELKQ14680 651 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 PTGR1Q14914 329 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL26Q53HC5 615 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 MANEAQ5SRI9 462 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ALS2CLQ60I27 953 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZTK2 550 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM199Q8N511 208 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 CHFRQ96EP1 664 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 COX11Q9Y6N1 276 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCC9O60706 1549 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SMTNL1A8MU46 457 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 BECN2A8MW95 431 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD28O15084 1053 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNN4O15554 427 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 GOSR1O95249 250 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 LCATP04180 440 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 FGF2P09038 288 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TGFB3P10600 412 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 HSPB3Q12988 150 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 CTF1Q16619 201 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SHC4Q6S5L8 630 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF534Q76KX8 674 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 CORO2AQ92828 525 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-205ENST00000514178 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms