RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.56■■■□□ 2.48
PGGT1B-205ENST00000514178 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PGGT1B-205ENST00000514178 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PGGT1B-205ENST00000514178 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.23■■□□□ 1.63
PGGT1B-205ENST00000514178 ADRA2BP18089 450 aa23.66■■□□□ 1.38
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXD1Q16676 465 aa23.64■■□□□ 1.37
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.52■■□□□ 1.36
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNA4P22459 653 aa22.98■■□□□ 1.27
PGGT1B-205ENST00000514178 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.55■■□□□ 1.2
PGGT1B-205ENST00000514178 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.37■■□□□ 1.17
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PGGT1B-205ENST00000514178 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PGGT1B-205ENST00000514178 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.83■■□□□ 1.09
PGGT1B-205ENST00000514178 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PGGT1B-205ENST00000514178 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.51■■□□□ 1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PGGT1B-205ENST00000514178 MSH5O43196 834 aa21.37■■□□□ 1.01
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB22O15209 634 aa21.19■□□□□ 0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.95■□□□□ 0.94
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.85■□□□□ 0.93
PGGT1B-205ENST00000514178 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.58■□□□□ 0.89
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC4A2P04920 1241 aa20.32■□□□□ 0.84
PGGT1B-205ENST00000514178 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PGGT1B-205ENST00000514178 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20■□□□□ 0.79
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP8Q14318 412 aa19.67■□□□□ 0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
PGGT1B-205ENST00000514178 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.63■□□□□ 0.73
PGGT1B-205ENST00000514178 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PGGT1B-205ENST00000514178 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-205ENST00000514178 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC24A1O60721 1099 aa19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
PGGT1B-205ENST00000514178 APLP2Q06481 763 aa18.95■□□□□ 0.62
PGGT1B-205ENST00000514178 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.71■□□□□ 0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO3Q9UK99 471 aa18.66■□□□□ 0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 FBLN2P98095 1184 aa18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PROM2Q8N271 834 aa18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 POLA2Q14181 598 aa18.48■□□□□ 0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF39Q9H2S5 420 aa18.44■□□□□ 0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 VASPP50552 380 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPN15O75808 1086 aa18.4■□□□□ 0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCB7O75027 752 aa18.17■□□□□ 0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCB2Q00722 1185 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 PKD2Q13563 968 aa18.03■□□□□ 0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18■□□□□ 0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PGGT1B-205ENST00000514178 DSG3P32926 999 aa17.88■□□□□ 0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL34Q8N239 644 aa17.86■□□□□ 0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SPOCK2Q92563 424 aa17.85■□□□□ 0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 OSCARQ8IYS5 282 aa17.84■□□□□ 0.45
PGGT1B-205ENST00000514178 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.83■□□□□ 0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 SPDYE6P0CI01 402 aa17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.82■□□□□ 0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 SSUH2Q9Y2M2 353 aa17.81■□□□□ 0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEDQ86YR6 584 aa17.8■□□□□ 0.44
PGGT1B-205ENST00000514178 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.71■□□□□ 0.43
PGGT1B-205ENST00000514178 MIER1Q8N108 512 aa17.62■□□□□ 0.41
PGGT1B-205ENST00000514178 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
PGGT1B-205ENST00000514178 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-205ENST00000514178 VSIG10Q8N0Z9 540 aa17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PGGT1B-205ENST00000514178 RGL2O15211 777 aa17.54■□□□□ 0.4
PGGT1B-205ENST00000514178 BCANQ96GW7 911 aa17.47■□□□□ 0.39
PGGT1B-205ENST00000514178 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHG5O94827 1062 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 CFAP44Q96MT7 982 aa17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
PGGT1B-205ENST00000514178 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.37■□□□□ 0.37
PGGT1B-205ENST00000514178 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.3■□□□□ 0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM41Q8WV44 630 aa17.26■□□□□ 0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.22■□□□□ 0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa17.21■□□□□ 0.35
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
PGGT1B-205ENST00000514178 GSE1Q14687 1217 aa17.14■□□□□ 0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 HS6ST3Q8IZP7 471 aa17.13■□□□□ 0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 NUBP1P53384 320 aa17.1■□□□□ 0.33
PGGT1B-205ENST00000514178 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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