RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400060.8

PTPRM-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-203ENST00000400060 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 JRKO75564 520 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 TMEM63AO94886 807 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 FABP3P05413 133 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 KELP23276 732 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 MAP2K3P46734 347 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SMIM11AP58511 58 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 RPA4Q13156 261 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SLC13A2Q13183 592 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 PGAP1Q75T13 922 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 OR7G3Q8NG95 312 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 MYRFLQ96LU7 910 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 MUS81Q96NY9 551 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 XKR8Q9H6D3 395 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 OLAHQ9NV23 265 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 COL20A1Q9P218 1284 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 AKT3Q9Y243 479 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 ASB4Q9Y574 426 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 BCL9O00512 1426 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SLC28A1O00337 649 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 CALCAP01258 141 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 L1CAMP32004 1257 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 ACOT2P49753 483 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 GDI2P50395 445 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 STX4Q12846 297 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 CAMK2BQ13554 666 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 LRRC58Q96CX6 371 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 FEM1AQ9BSK4 669 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 NANOGQ9H9S0 305 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SLITRK3O94933 977 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 CPNE6O95741 557 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 LCN1P31025 176 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 MAPKAPK2P49137 400 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 DNAJB13P59910 316 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 CLCA4Q14CN2 919 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 TIGD3Q6B0B8 471 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 KRT78Q8N1N4 520 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 IPMKQ8NFU5 416 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 RNF121Q9H920 327 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 FAM234BA2RU67 622 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 M0R2N6 131 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 OR56A5P0C7T3 313 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 DGKQP52824 942 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 DEFA5Q01523 94 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 SEMA5AQ13591 1074 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 PCSK7Q16549 785 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 PHF21BQ96EK2 531 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 PIF1Q9H611 641 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 SP110Q9HB58 689 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ACP6Q9NPH0 428 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 SLC19A2O60779 497 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 C9P02748 559 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ELK4P28324 431 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 PRMT2P55345 433 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 CXCR4P61073 352 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ADAM15Q13444 863 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 DSC3Q14574 896 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 LIN54Q6MZP7 749 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ABI1Q8IZP0 508 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 ITCHQ96J02 903 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-203ENST00000400060 EXOC2Q96KP1 924 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms