RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258104.7

DYSF-201, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-201ENST00000258104 DEFA5Q01523 94 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 UGCGQ16739 394 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 DCST1Q5T197 706 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CPS1P31327 1500 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 OR14I1A6ND48 311 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 RASGRP1O95267 797 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PEX2P28328 305 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 RYKP34925 604 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CRHR1P34998 444 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SLC30A4O14863 429 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 OR4Q2P0C623 313 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 HTR1BP28222 390 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 BRCC3P46736 316 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PSMD8P48556 350 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 BNC1Q01954 994 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ECM1Q16610 540 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 AIREO43918 545 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 C22orf31O95567 290 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ATP6V0D1P61421 351 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CAPSQ13938 189 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 IL23RQ5VWK5 629 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 UNC93AQ86WB7 457 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ZNF558Q96NG5 402 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NMUR1Q9HB89 426 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 MLXQ9UH92 298 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.9□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 IRGMA1A4Y4 181 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 CLPXO76031 633 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 PGLSO95336 258 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 COPS8Q99627 209 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 MED31Q9Y3C7 131 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 CCL16O15467 120 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 NUDT17P0C025 328 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 AQP4P55087 323 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 DNASE1L3Q13609 305 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 C17orf64Q86WR6 236 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 ZBTB2Q8N680 514 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 WFS1O76024 890 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 FCER2P06734 321 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 ECT2LQ008S8 904 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 TLR1Q15399 786 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 OR2AG2A6NM03 316 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 ZNF208O43345 1280 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 MFSD11O43934 449 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 APOC1P02654 83 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 GJA8P48165 433 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 GPR21Q99679 349 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 CLUHO75153 1309 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 TLR5O60602 858 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 CCNE2O96020 404 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 GTF2H2Q13888 395 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 OR10A6Q8NH74 314 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 HM13Q8TCT9 377 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.89□□□□□ -0.03
DYSF-201ENST00000258104 FKBP7Q9Y680 259 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms