RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	CWC24	P53769	259 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YNL011C	P53980	444 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YPQ2	Q06328	317 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	OSW2	Q12202	724 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	CMP2	P14747	604 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SPC29	P33419	253 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	LAM1	P38851	1228 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MSE1	P48525	536 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	GLO1	P50107	326 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PUS2	P53167	370 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	DAM1	P53267	343 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ROT1	Q03691	256 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	BSC2	Q05611	235 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YCS4	Q06156	1176 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YAP7	Q08182	245 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	GPB1	Q08886	897 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PTC5	Q12511	572 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SOD2	P00447	233 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MET3	P08536	511 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SPO11	P23179	398 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	DMC1	P25453	334 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	TTI1	P36097	1038 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	TAT2	P38967	592 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MRPS18	P42847	217 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ALD2	P47771	506 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	EST2	Q06163	884 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	AFT2	Q08957	416 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YPL277C	Q08989	487 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	GLO4	Q12320	285 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.48	□□□□□ -2.33	not detected
SOV1	YMR066W	ERS1	P17261	260 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ADD66	P36040	267 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MCM7	P38132	845 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SUL1	P38359	859 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	CCC2	P38995	1004 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ROM1	P53046	1155 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	DMA2	P53924	522 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	TAF7	Q05021	590 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MRX10	Q05648	414 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ORM2	Q06144	216 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RSC58	Q07979	502 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.48	□□□□□ -2.33	not detected
SOV1	YMR066W	YPL260W	Q08977	551 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SVS1	Q12254	260 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YVC1	Q12324	675 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SPO21	Q12411	609 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	NPR1	P22211	790 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SEC15	P22224	910 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HXT5	P38695	592 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PIK1	P39104	1066 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ZRG8	P40021	1076 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YER158C	P40095	573 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ATF1	P40353	525 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	XKS1	P42826	600 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	APL6	P46682	809 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	BFA1	P47113	574 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ACF4	P47129	309 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	CTF4	Q01454	927 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SPO20	Q04359	397 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	DAL4	Q04895	635 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ACF2	Q12168	779 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RLF2	Q12495	606 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RPC31	P17890	251 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	KIN3	P22209	435 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SED4	P25365	1065 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SEC20	P28791	383 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PPZ2	P33329	710 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	VPS35	P34110	944 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SAP190	P36123	1033 aa		0.47	□□□□□ -2.33

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