RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W OPT2Q06593 877 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W SEC23P15303 768 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data6.94□□□□□ -1.3not detected
VHS1YDR247W YJL181WP46987 611 aa6.94□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W YGL140CP53120 1219 aa6.94□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W GLO4Q12320 285 aa6.94□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W RAD4P14736 754 aa6.93□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W RRP14P36080 434 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W KRI1P42846 591 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W GNP1P48813 663 aa6.93□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W HUL5P53119 910 aa6.93□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W EEB1Q02891 456 aa6.93□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W NTE1Q04958 1679 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W BAS1P22035 811 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W MSH3P25336 1018 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W YKL069WP36088 180 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W INP51P40559 946 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W BUD6P41697 788 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W TIM54P47045 478 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W SCW11P53189 542 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W ALG12P53730 551 aa6.92□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W MHP1P43638 1398 aa6.91□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W CCP1P00431 361 aa6.91□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W FPR3P38911 411 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data6.91□□□□□ -1.3not detected
VHS1YDR247W HDA2Q06629 674 aa6.91□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W BIO5P53744 561 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W DIT1P21623 536 aa6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W YKL077WP36081 392 aa6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W MSC7P38694 644 aa6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W ENT3P47160 408 aa6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W SIW14P53965 281 aa6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W SPO20Q04359 397 aa6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W TY1A-BLQ12266 440 aa6.89□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W HVG1P0CE11 249 aa6.88□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W YJR124CP47159 448 aa6.88□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W TYW3P53177 273 aa6.88□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data6.88□□□□□ -1.31not detected
VHS1YDR247W TRP2P00899 507 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W VMA4P22203 233 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W FPS1P23900 669 aa6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W LYP1P32487 611 aa6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W TFA2P36145 328 aa6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W EXO5P38289 585 aa6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W FET4P40988 552 aa6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W FAR11P53917 953 aa6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W SOG2Q08817 791 aa6.87□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W HEM13P11353 328 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W AGP1P25376 633 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W RER2P35196 286 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W RDH54P38086 958 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W HXT13P39924 564 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W PRK1P40494 810 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W LSB6P42951 607 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W HXT17P53631 564 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W HXT15P54854 567 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W SPO75Q07798 868 aa6.86□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W BUD3P25558 1636 aa6.85□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W HTS1P07263 546 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W NUP82P40368 713 aa6.85□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W YNR065CP53751 1116 aa6.85□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W CUZ1P53899 274 aa6.85□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W REC8Q12188 680 aa6.85□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W SBA1P28707 216 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W MRP8P35719 219 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W YBR184WP38299 523 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W ROG3P43602 733 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W ROD1Q02805 837 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W SHE9Q04172 456 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W PPM2Q08282 695 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W FLC1Q08967 793 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W OSH2Q12451 1283 aa6.84□□□□□ -1.31
VHS1YDR247W MRP10O75012 95 aa6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W MET6P05694 767 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data6.83□□□□□ -1.32not detected
VHS1YDR247W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W NEO1P40527 1151 aa6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W GUP1P53154 560 aa6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W TY1A-MR1Q04215 440 aa6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W POB3Q04636 552 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W PDR12Q02785 1511 aa6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W IQG1Q12280 1495 aa6.83□□□□□ -1.32
VHS1YDR247W MMS1Q06211 1407 aa6.83□□□□□ -1.32
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