RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554358.1

OTX2-AS1-202, Transcript of OTX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene OTX2-AS1, Length 541 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2-AS1-202ENST00000554358 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
OTX2-AS1-202ENST00000554358 NBPF11Q86T75 865 aa8.4□□□□□ -1.06
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.4□□□□□ -1.06
OTX2-AS1-202ENST00000554358 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.39□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.39□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 NDUFV2P19404 249 aa8.38□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 DBN1Q16643 649 aa8.38□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RRAGCQ9HB90 399 aa8.38□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.37□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TOPBP1Q92547 1522 aa8.37□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 COBLO75128 1261 aa8.36□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.36□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GMCL1Q96IK5 515 aa8.36□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 MX2P20592 715 aa8.35□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 MTMR2Q13614 643 aa8.35□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.34□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.34□□□□□ -1.07
OTX2-AS1-202ENST00000554358 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.33□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.32□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.32□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.31□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 CUX1P39880 1505 aa8.3□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RHOQP17081 205 aa8.3□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.3□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.29□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.29□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.29□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.29□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 IFT140Q96RY7 1462 aa8.29□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.29□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.28□□□□□ -1.08
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ABCC8Q09428 1581 aa8.27□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 CHD1O14646 1710 aa8.27□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 CFAP99D6REC4 459 aa8.27□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.27□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.27□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.27□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.26□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 IRF6O14896 467 aa8.26□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GATA4P43694 442 aa8.26□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 MAP2K5Q13163 448 aa8.26□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GNB5O14775 395 aa8.25□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 MAP2K3P46734 347 aa8.25□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 KLRG1Q96E93 195 aa8.25□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.25□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.24□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 WDR97A6NE52 1622 aa8.24□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 SOGA1O94964 1423 aa8.23□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 H7C1W4 665 aa8.23□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ERFEQ4G0M1 354 aa8.23□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.23□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 AMPD1P23109 780 aa8.22□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 CLCN1P35523 988 aa8.22□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 SYNJ1O43426 1573 aa8.22□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PBRM1Q86U86 1689 aa8.21□□□□□ -1.09
OTX2-AS1-202ENST00000554358 DYRK3O43781 588 aa8.21□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PTGIRP43119 386 aa8.21□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.21□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PIK3R2O00459 728 aa8.2□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ZMYND10O75800 440 aa8.2□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.19□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.19□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.19□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.19□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.19□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 NBPF14Q5TI25 921 aa8.19□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.19□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ADH1AP07327 375 aa8.18□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 LRP8Q14114 963 aa8.18□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.18□□□□□ -1.1
OTX2-AS1-202ENST00000554358 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms