RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-208ENST00000486192 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.99□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 NUDCQ9Y266 331 aa11.99□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 NCAPD2Q15021 1401 aa11.99□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.98□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.98□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 IL13P35225 146 aa11.98□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 NBPF14Q5TI25 921 aa11.98□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 SPON1Q9HCB6 807 aa11.98□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 KCNQ2O43526 872 aa11.97□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 PDE3BQ13370 1112 aa11.97□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.96□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 NBPF4Q96M43 638 aa11.96□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 EYA1Q99502 592 aa11.96□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SORCS1-208ENST00000486192 KDRP35968 1356 aa11.95□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.94□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 IL2RBP14784 551 aa11.94□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.94□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 CCER2I3L3R5 266 aa11.93□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 FCHSD2O94868 740 aa11.92□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 ZBTB7AO95365 584 aa11.92□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.92□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.92□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 RGPD5Q99666 1765 aa11.92□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.91□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.91□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 MRS2Q9HD23 443 aa11.91□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 DDB1Q16531 1140 aa11.9□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 TNS2Q63HR2 1409 aa11.9□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 SBF2Q86WG5 1849 aa11.9□□□□□ -0.5
SORCS1-208ENST00000486192 EXOC5O00471 708 aa11.89□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 NEFMP07197 916 aa11.89□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.89□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 SPG7Q9UQ90 795 aa11.89□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 MEGF6O75095 1541 aa11.89□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.88□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.88□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 UTRNP46939 3433 aa11.88□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 CHD4Q14839 1912 aa11.88□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.88□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 CASZ1Q86V15 1759 aa11.87□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 HMOX1P09601 288 aa11.87□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.87□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 BCL9O00512 1426 aa11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PRKAR2BP31323 418 aa11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 C1QTNF8P60827 252 aa11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 LRRC37A3O60309 1634 aa11.86□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PTGER2P43116 358 aa11.85□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.85□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 IFFO2Q5TF58 517 aa11.84□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.84□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 MIER1Q8N108 512 aa11.84□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PROM2Q8N271 834 aa11.84□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.84□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 SYT17Q9BSW7 474 aa11.84□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.84□□□□□ -0.51
SORCS1-208ENST00000486192 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.83□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.83□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 CCDC184Q52MB2 194 aa11.83□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.83□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.83□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 RUNDC1Q96C34 613 aa11.83□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 PHKG2P15735 406 aa11.82□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 CYP27B1O15528 508 aa11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 NGEFQ8N5V2 710 aa11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 DCAF5Q96JK2 942 aa11.81□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.8□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 PLSCR1O15162 318 aa11.8□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.8□□□□□ -0.52
SORCS1-208ENST00000486192 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms