RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC1Q9BTT6 524 aa26.48■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC61Q9BV99 259 aa26.48■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ARFGAP3Q9NP61 516 aa26.48■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 UCKL1Q9NWZ5 548 aa26.48■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa26.48■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP54Q96N23 3096 aa26.48■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC162PA2VCL2 907 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 TPP1O14773 563 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ALPPL2P10696 532 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 NMBRP28336 390 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2H3Q13889 308 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 KCTD16Q68DU8 428 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 LVRNQ6Q4G3 990 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 PIP4P1Q86T03 277 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GKN2Q86XP6 184 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 NAXDQ8IW45 347 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 NXPE1Q8N323 547 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 MPP5Q8N3R9 675 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 OR4L1Q8NH43 312 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 TTC1Q99614 292 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP23Q9BVJ7 150 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM168Q9H0V1 697 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 DPH5Q9H2P9 285 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 SLC32A1Q9H598 525 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GPSM3Q9Y4H4 160 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa26.47■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 LMO7DNF2Z398 122 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 CHUKO15111 745 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GRID2O43424 1007 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 SH3BP5O60239 455 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GOT2P00505 430 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 RALBP11234 206 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 PAMP19021 973 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 MSH3P20585 1137 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ARL4CP56559 192 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 CAV1Q03135 178 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf61Q13536 156 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 OR2M4Q96R27 311 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 NAT9Q9BTE0 207 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 CLPBQ9H078 707 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 FAM96AQ9H5X1 160 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 NLGN3Q9NZ94 848 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 DMXL1Q9Y485 3027 aa26.46■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GPR39O43194 453 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 MTX2O75431 263 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ANXA6P08133 673 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 LRP8Q14114 963 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 FNBP1LQ5T0N5 605 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM135Q86UB9 458 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GPBAR1Q8TDU6 330 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC39Q96DD0 335 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 MFSD3Q96ES6 412 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 DCUN1D1Q96GG9 259 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 COPS8Q99627 209 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 GSDMCQ9BYG8 508 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 DNAH14Q0VDD8 3507 aa26.45■■□□□ 1.83
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP99D6REC4 459 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TP73O15350 636 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ACRV1P26436 265 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 AKT1P31749 480 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CA5AP35218 305 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 HIF1AQ16665 826 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CERS6Q6ZMG9 384 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 TAF8Q7Z7C8 310 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CCNJLQ8IV13 435 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 EID2Q8N6I1 236 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 OR4C6Q8NH72 309 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CDC6Q99741 560 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CARD6Q9BX69 1037 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 CAAP1Q9H8G2 361 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 GPR34Q9UPC5 381 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 BPTFQ12830 3046 aa26.44■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 KMOO15229 486 aa26.43■■□□□ 1.82
CRIP1-201ENST00000330233 YY2O15391 372 aa26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms