RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CNGA4	Q8IV77	575 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NCSTN	Q92542	709 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	AGAP2	Q99490	1192 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	F3	P13726	295 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	DCDC1	P59894	354 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NFATC2	Q13469	925 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	GALNT3	Q14435	633 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PCSK7	Q16549	785 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	INSC	Q1MX18	579 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	VASH2	Q86V25	355 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SMIM14	Q96QK8	99 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	BPTF	Q12830	3046 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KMO	O15229	486 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SLC28A2	O43868	658 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	VEGFD	O43915	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	VIP	P01282	170 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SLC4A1	P02730	911 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TNNT1	P13805	278 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MPST	P25325	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MAPK9	P45984	424 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CLCNKA	P51800	687 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	GTF2H3	Q13889	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	VSTM4	Q8IW00	320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	EXTL1	Q92935	676 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743		A8MU76	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MFAP3L	O75121	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CDK14	O94921	469 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NDST3	O95803	873 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MMP2	P08253	660 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	DYNLT1	P63172	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ALS2CL	Q60I27	953 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-208	ENST00000579743	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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