RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppa2Q91VM9 330 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dio3Q91ZI8 304 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mccc1Q99MR8 717 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Golga1Q9CW79 758 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dennd6bQ9D9V7 585 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp839E9PUU5 921 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Casq2O09161 415 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sypl2O89104 264 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Msx1P13297 303 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vav1P27870 845 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zc4h2Q68FG0 224 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ovch2Q7M761 609 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Haus4Q8BFT2 363 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 C130026I21RikQ8C898 291 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mptx1Q8R1M8 219 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc39a3Q99K24 317 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prss23Q9D6X6 382 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Reg4Q9D8G5 157 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tubb3Q9ERD7 450 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scamp5Q9JKD3 235 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm35060A0A140LIV7 231 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Awat1A2ADU9 328 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mup6A2AV72 179 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf169E9Q7F2 694 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm5134E9QAB5 671 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bub1O08901 1058 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ifnb1P01575 182 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Klra1P20937 262 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc6a11P31650 627 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ube2e3P52483 207 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd244Q07763 397 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hddc2Q3SXD3 199 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spc25Q3UA16 226 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rhox12Q4TU81 186 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Xkr9Q5GH62 373 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 FntaQ61239 377 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nek5Q7TSC3 627 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Actl9Q8CG27 415 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr695Q8VFM3 315 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp65Q91W94 390 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ca13Q9D6N1 262 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PigqQ9QYT7 581 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppm1dQ9QZ67 598 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Angptl3Q9R182 455 aa7.13□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Chd5A2A8L1 1946 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r77L7N2B7 854 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lmo2P25801 158 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Traf6P70196 530 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TsxP70675 144 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tnks2Q3UES3 1166 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Msrb2Q78J03 175 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mup21Q80YX8 181 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rcn2Q8BP92 320 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zbtb49Q8BXX2 756 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Syt15Q8C6N3 418 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rdh1Q8CGV4 317 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spag16Q8K450 639 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Acot7Q91V12 381 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SmtnQ921U8 923 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NapgQ9CWZ7 312 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Aar2Q9D2V5 384 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ndst4Q9EQW8 872 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spry1Q9QXV9 313 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ap1m2Q9WVP1 423 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ifi213D3Z5G0 586 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm1110F6Y113 635 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pdlim1O70400 327 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Znf703P0CL69 594 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab20P35295 233 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Grm5Q3UVX5 1203 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trim75Q3UWZ0 467 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kif26aQ52KG5 1881 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nr1h2Q60644 446 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Krt77Q6IFZ6 572 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mcoln2Q8K595 566 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn1r212Q8R268 357 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sh2d4aQ9D7V1 421 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nubp1Q9R060 320 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r38G3UYA8 861 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm20878L7N244 103 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r44L7N2E1 861 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AvilO88398 819 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Klc1O88447 541 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Myf5P24699 255 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fen1P39749 378 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LipeP54310 759 aa7.12□□□□□ -1.27
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pfdn4Q3UWL8 134 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms