Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0R2

Ppp1r36, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 36, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r36D3Z0R2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ppp1r36D3Z0R2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ppp1r36D3Z0R2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ppp1r36D3Z0R2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ppp1r36D3Z0R2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ppp1r36D3Z0R2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ppp1r36D3Z0R2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ppp1r36D3Z0R2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ppp1r36D3Z0R2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ppp1r36D3Z0R2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppp1r36D3Z0R2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ppp1r36D3Z0R2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ppp1r36D3Z0R2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ppp1r36D3Z0R2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ppp1r36D3Z0R2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ppp1r36D3Z0R2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ppp1r36D3Z0R2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ppp1r36D3Z0R2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ppp1r36D3Z0R2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ppp1r36D3Z0R2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ppp1r36D3Z0R2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ppp1r36D3Z0R2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppp1r36D3Z0R2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppp1r36D3Z0R2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ppp1r36D3Z0R2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ppp1r36D3Z0R2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ppp1r36D3Z0R2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ppp1r36D3Z0R2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ppp1r36D3Z0R2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ppp1r36D3Z0R2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppp1r36D3Z0R2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppp1r36D3Z0R2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ppp1r36D3Z0R2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppp1r36D3Z0R2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ppp1r36D3Z0R2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppp1r36D3Z0R2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppp1r36D3Z0R2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppp1r36D3Z0R2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ppp1r36D3Z0R2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp1r36D3Z0R2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppp1r36D3Z0R2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppp1r36D3Z0R2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppp1r36D3Z0R2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppp1r36D3Z0R2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppp1r36D3Z0R2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppp1r36D3Z0R2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ppp1r36D3Z0R2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppp1r36D3Z0R2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp1r36D3Z0R2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppp1r36D3Z0R2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ppp1r36D3Z0R2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppp1r36D3Z0R2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppp1r36D3Z0R2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppp1r36D3Z0R2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppp1r36D3Z0R2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ppp1r36D3Z0R2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppp1r36D3Z0R2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppp1r36D3Z0R2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppp1r36D3Z0R2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppp1r36D3Z0R2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppp1r36D3Z0R2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppp1r36D3Z0R2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppp1r36D3Z0R2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppp1r36D3Z0R2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppp1r36D3Z0R2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppp1r36D3Z0R2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppp1r36D3Z0R2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp1r36D3Z0R2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ppp1r36D3Z0R2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r36D3Z0R2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r36D3Z0R2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp1r36D3Z0R2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp1r36D3Z0R2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp1r36D3Z0R2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp1r36D3Z0R2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp1r36D3Z0R2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp1r36D3Z0R2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp1r36D3Z0R2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp1r36D3Z0R2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r36D3Z0R2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r36D3Z0R2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp1r36D3Z0R2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp1r36D3Z0R2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp1r36D3Z0R2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r36D3Z0R2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp1r36D3Z0R2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r36D3Z0R2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r36D3Z0R2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp1r36D3Z0R2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp1r36D3Z0R2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r36D3Z0R2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r36D3Z0R2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp1r36D3Z0R2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r36D3Z0R2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r36D3Z0R2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r36D3Z0R2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp1r36D3Z0R2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r36D3Z0R2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppp1r36D3Z0R2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r36D3Z0R2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms