Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP1

Ap1m2, AP-1 complex subunit mu-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1m2Q9WVP1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Ap1m2Q9WVP1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ap1m2Q9WVP1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap1m2Q9WVP1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ap1m2Q9WVP1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ap1m2Q9WVP1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ap1m2Q9WVP1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Ap1m2Q9WVP1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap1m2Q9WVP1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ap1m2Q9WVP1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ap1m2Q9WVP1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ap1m2Q9WVP1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap1m2Q9WVP1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap1m2Q9WVP1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap1m2Q9WVP1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap1m2Q9WVP1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ap1m2Q9WVP1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ap1m2Q9WVP1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ap1m2Q9WVP1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ap1m2Q9WVP1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ap1m2Q9WVP1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap1m2Q9WVP1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap1m2Q9WVP1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap1m2Q9WVP1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ap1m2Q9WVP1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap1m2Q9WVP1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ap1m2Q9WVP1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ap1m2Q9WVP1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ap1m2Q9WVP1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ap1m2Q9WVP1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap1m2Q9WVP1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap1m2Q9WVP1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap1m2Q9WVP1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap1m2Q9WVP1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap1m2Q9WVP1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ap1m2Q9WVP1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ap1m2Q9WVP1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap1m2Q9WVP1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap1m2Q9WVP1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap1m2Q9WVP1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap1m2Q9WVP1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap1m2Q9WVP1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ap1m2Q9WVP1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap1m2Q9WVP1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap1m2Q9WVP1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap1m2Q9WVP1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap1m2Q9WVP1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap1m2Q9WVP1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap1m2Q9WVP1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap1m2Q9WVP1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap1m2Q9WVP1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap1m2Q9WVP1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap1m2Q9WVP1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap1m2Q9WVP1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap1m2Q9WVP1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap1m2Q9WVP1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap1m2Q9WVP1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ap1m2Q9WVP1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap1m2Q9WVP1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap1m2Q9WVP1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap1m2Q9WVP1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap1m2Q9WVP1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap1m2Q9WVP1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap1m2Q9WVP1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap1m2Q9WVP1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap1m2Q9WVP1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap1m2Q9WVP1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ap1m2Q9WVP1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap1m2Q9WVP1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ap1m2Q9WVP1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap1m2Q9WVP1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap1m2Q9WVP1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ap1m2Q9WVP1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap1m2Q9WVP1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ap1m2Q9WVP1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap1m2Q9WVP1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ap1m2Q9WVP1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ap1m2Q9WVP1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap1m2Q9WVP1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap1m2Q9WVP1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ap1m2Q9WVP1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ap1m2Q9WVP1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ap1m2Q9WVP1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap1m2Q9WVP1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ap1m2Q9WVP1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap1m2Q9WVP1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap1m2Q9WVP1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap1m2Q9WVP1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap1m2Q9WVP1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ap1m2Q9WVP1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ap1m2Q9WVP1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap1m2Q9WVP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap1m2Q9WVP1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap1m2Q9WVP1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ap1m2Q9WVP1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ap1m2Q9WVP1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ap1m2Q9WVP1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap1m2Q9WVP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap1m2Q9WVP1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ap1m2Q9WVP1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms