Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Trim75Q3UWZ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Trim75Q3UWZ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Trim75Q3UWZ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Trim75Q3UWZ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Trim75Q3UWZ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Trim75Q3UWZ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Trim75Q3UWZ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Trim75Q3UWZ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Trim75Q3UWZ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Trim75Q3UWZ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Trim75Q3UWZ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Trim75Q3UWZ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Trim75Q3UWZ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Trim75Q3UWZ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Trim75Q3UWZ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Trim75Q3UWZ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Trim75Q3UWZ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Trim75Q3UWZ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Trim75Q3UWZ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Trim75Q3UWZ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Trim75Q3UWZ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Trim75Q3UWZ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trim75Q3UWZ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trim75Q3UWZ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Trim75Q3UWZ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Trim75Q3UWZ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Trim75Q3UWZ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Trim75Q3UWZ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Trim75Q3UWZ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Trim75Q3UWZ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Trim75Q3UWZ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Trim75Q3UWZ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Trim75Q3UWZ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Trim75Q3UWZ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Trim75Q3UWZ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Trim75Q3UWZ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Trim75Q3UWZ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Trim75Q3UWZ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Trim75Q3UWZ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Trim75Q3UWZ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Trim75Q3UWZ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Trim75Q3UWZ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Trim75Q3UWZ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Trim75Q3UWZ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Trim75Q3UWZ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Trim75Q3UWZ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Trim75Q3UWZ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Trim75Q3UWZ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Trim75Q3UWZ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Trim75Q3UWZ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Trim75Q3UWZ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Trim75Q3UWZ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Trim75Q3UWZ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Trim75Q3UWZ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Trim75Q3UWZ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Trim75Q3UWZ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Trim75Q3UWZ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Trim75Q3UWZ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim75Q3UWZ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Trim75Q3UWZ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Trim75Q3UWZ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Trim75Q3UWZ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Trim75Q3UWZ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Trim75Q3UWZ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Trim75Q3UWZ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Trim75Q3UWZ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Trim75Q3UWZ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim75Q3UWZ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim75Q3UWZ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Trim75Q3UWZ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim75Q3UWZ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim75Q3UWZ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Trim75Q3UWZ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Trim75Q3UWZ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Trim75Q3UWZ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Trim75Q3UWZ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Trim75Q3UWZ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Trim75Q3UWZ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Trim75Q3UWZ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Trim75Q3UWZ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Trim75Q3UWZ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Trim75Q3UWZ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim75Q3UWZ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim75Q3UWZ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Trim75Q3UWZ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Trim75Q3UWZ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Trim75Q3UWZ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Trim75Q3UWZ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Trim75Q3UWZ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Trim75Q3UWZ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Trim75Q3UWZ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Trim75Q3UWZ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Trim75Q3UWZ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Trim75Q3UWZ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Trim75Q3UWZ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Trim75Q3UWZ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Trim75Q3UWZ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Trim75Q3UWZ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Trim75Q3UWZ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms