Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW79

Golga1, Golgin subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Golga1Q9CW79 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Golga1Q9CW79 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Golga1Q9CW79 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Golga1Q9CW79 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Golga1Q9CW79 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,97■■■□□ 2,87
Golga1Q9CW79 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Golga1Q9CW79 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Golga1Q9CW79 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Golga1Q9CW79 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Golga1Q9CW79 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Golga1Q9CW79 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Golga1Q9CW79 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Golga1Q9CW79 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Golga1Q9CW79 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Golga1Q9CW79 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Golga1Q9CW79 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Golga1Q9CW79 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Golga1Q9CW79 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Golga1Q9CW79 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Golga1Q9CW79 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Golga1Q9CW79 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Golga1Q9CW79 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
Golga1Q9CW79 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Golga1Q9CW79 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Golga1Q9CW79 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Golga1Q9CW79 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Golga1Q9CW79 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Golga1Q9CW79 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Golga1Q9CW79 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Golga1Q9CW79 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Golga1Q9CW79 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Golga1Q9CW79 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Golga1Q9CW79 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Golga1Q9CW79 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Golga1Q9CW79 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Golga1Q9CW79 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Golga1Q9CW79 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Golga1Q9CW79 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Golga1Q9CW79 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Golga1Q9CW79 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Golga1Q9CW79 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Golga1Q9CW79 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Golga1Q9CW79 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Golga1Q9CW79 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Golga1Q9CW79 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Golga1Q9CW79 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Golga1Q9CW79 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Golga1Q9CW79 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Golga1Q9CW79 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Golga1Q9CW79 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Golga1Q9CW79 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Golga1Q9CW79 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Golga1Q9CW79 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Golga1Q9CW79 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Golga1Q9CW79 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Golga1Q9CW79 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Golga1Q9CW79 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Golga1Q9CW79 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Golga1Q9CW79 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Golga1Q9CW79 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Golga1Q9CW79 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Golga1Q9CW79 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Golga1Q9CW79 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Golga1Q9CW79 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Golga1Q9CW79 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Golga1Q9CW79 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Golga1Q9CW79 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Golga1Q9CW79 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Golga1Q9CW79 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Golga1Q9CW79 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Golga1Q9CW79 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Golga1Q9CW79 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Golga1Q9CW79 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Golga1Q9CW79 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Golga1Q9CW79 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Golga1Q9CW79 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Golga1Q9CW79 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Golga1Q9CW79 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Golga1Q9CW79 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Golga1Q9CW79 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Golga1Q9CW79 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Golga1Q9CW79 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Golga1Q9CW79 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Golga1Q9CW79 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Golga1Q9CW79 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Golga1Q9CW79 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Golga1Q9CW79 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Golga1Q9CW79 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Golga1Q9CW79 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Golga1Q9CW79 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Golga1Q9CW79 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Golga1Q9CW79 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Golga1Q9CW79 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Golga1Q9CW79 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Golga1Q9CW79 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Golga1Q9CW79 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Golga1Q9CW79 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Golga1Q9CW79 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Golga1Q9CW79 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Golga1Q9CW79 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57,4 ms