Protein–RNA interactions for Protein: Q9R182

Angptl3, Angiopoietin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Angptl3Q9R182 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Angptl3Q9R182 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Angptl3Q9R182 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Angptl3Q9R182 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Angptl3Q9R182 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Angptl3Q9R182 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Angptl3Q9R182 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Angptl3Q9R182 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Angptl3Q9R182 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Angptl3Q9R182 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Angptl3Q9R182 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Angptl3Q9R182 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Angptl3Q9R182 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Angptl3Q9R182 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Angptl3Q9R182 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Angptl3Q9R182 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Angptl3Q9R182 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Angptl3Q9R182 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Angptl3Q9R182 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Angptl3Q9R182 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Angptl3Q9R182 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Angptl3Q9R182 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Angptl3Q9R182 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Angptl3Q9R182 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Angptl3Q9R182 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Angptl3Q9R182 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Angptl3Q9R182 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Angptl3Q9R182 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Angptl3Q9R182 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Angptl3Q9R182 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Angptl3Q9R182 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Angptl3Q9R182 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Angptl3Q9R182 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Angptl3Q9R182 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Angptl3Q9R182 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Angptl3Q9R182 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Angptl3Q9R182 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Angptl3Q9R182 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Angptl3Q9R182 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Angptl3Q9R182 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Angptl3Q9R182 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Angptl3Q9R182 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Angptl3Q9R182 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Angptl3Q9R182 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Angptl3Q9R182 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Angptl3Q9R182 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Angptl3Q9R182 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Angptl3Q9R182 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Angptl3Q9R182 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Angptl3Q9R182 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Angptl3Q9R182 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Angptl3Q9R182 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Angptl3Q9R182 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Angptl3Q9R182 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Angptl3Q9R182 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Angptl3Q9R182 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Angptl3Q9R182 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Angptl3Q9R182 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Angptl3Q9R182 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Angptl3Q9R182 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Angptl3Q9R182 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Angptl3Q9R182 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Angptl3Q9R182 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Angptl3Q9R182 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Angptl3Q9R182 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Angptl3Q9R182 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Angptl3Q9R182 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Angptl3Q9R182 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Angptl3Q9R182 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Angptl3Q9R182 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Angptl3Q9R182 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Angptl3Q9R182 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Angptl3Q9R182 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Angptl3Q9R182 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Angptl3Q9R182 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Angptl3Q9R182 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Angptl3Q9R182 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Angptl3Q9R182 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Angptl3Q9R182 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Angptl3Q9R182 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Angptl3Q9R182 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Angptl3Q9R182 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Angptl3Q9R182 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Angptl3Q9R182 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Angptl3Q9R182 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Angptl3Q9R182 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Angptl3Q9R182 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Angptl3Q9R182 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Angptl3Q9R182 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Angptl3Q9R182 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Angptl3Q9R182 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Angptl3Q9R182 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Angptl3Q9R182 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Angptl3Q9R182 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Angptl3Q9R182 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Angptl3Q9R182 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Angptl3Q9R182 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Angptl3Q9R182 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Angptl3Q9R182 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Angptl3Q9R182 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms