Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Nr1h2Q60644 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Nr1h2Q60644 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nr1h2Q60644 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nr1h2Q60644 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nr1h2Q60644 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nr1h2Q60644 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Nr1h2Q60644 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nr1h2Q60644 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Nr1h2Q60644 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Nr1h2Q60644 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nr1h2Q60644 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Nr1h2Q60644 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nr1h2Q60644 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nr1h2Q60644 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nr1h2Q60644 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Nr1h2Q60644 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nr1h2Q60644 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nr1h2Q60644 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nr1h2Q60644 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nr1h2Q60644 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Nr1h2Q60644 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nr1h2Q60644 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nr1h2Q60644 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nr1h2Q60644 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nr1h2Q60644 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nr1h2Q60644 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nr1h2Q60644 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nr1h2Q60644 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nr1h2Q60644 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nr1h2Q60644 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nr1h2Q60644 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nr1h2Q60644 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nr1h2Q60644 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nr1h2Q60644 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nr1h2Q60644 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nr1h2Q60644 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nr1h2Q60644 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nr1h2Q60644 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nr1h2Q60644 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nr1h2Q60644 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nr1h2Q60644 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr1h2Q60644 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nr1h2Q60644 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nr1h2Q60644 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nr1h2Q60644 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nr1h2Q60644 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nr1h2Q60644 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nr1h2Q60644 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nr1h2Q60644 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nr1h2Q60644 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nr1h2Q60644 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nr1h2Q60644 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nr1h2Q60644 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nr1h2Q60644 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nr1h2Q60644 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nr1h2Q60644 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nr1h2Q60644 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nr1h2Q60644 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nr1h2Q60644 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nr1h2Q60644 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nr1h2Q60644 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nr1h2Q60644 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nr1h2Q60644 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nr1h2Q60644 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nr1h2Q60644 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr1h2Q60644 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nr1h2Q60644 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nr1h2Q60644 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nr1h2Q60644 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nr1h2Q60644 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr1h2Q60644 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr1h2Q60644 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nr1h2Q60644 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr1h2Q60644 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr1h2Q60644 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nr1h2Q60644 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr1h2Q60644 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nr1h2Q60644 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nr1h2Q60644 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nr1h2Q60644 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr1h2Q60644 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nr1h2Q60644 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nr1h2Q60644 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nr1h2Q60644 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr1h2Q60644 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nr1h2Q60644 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nr1h2Q60644 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nr1h2Q60644 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nr1h2Q60644 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nr1h2Q60644 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nr1h2Q60644 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nr1h2Q60644 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr1h2Q60644 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Nr1h2Q60644 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nr1h2Q60644 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nr1h2Q60644 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nr1h2Q60644 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nr1h2Q60644 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nr1h2Q60644 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms