Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA16

Spc25, Kinetochore protein Spc25, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25Q3UA16 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Spc25Q3UA16 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Spc25Q3UA16 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Spc25Q3UA16 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Spc25Q3UA16 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Spc25Q3UA16 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Spc25Q3UA16 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Spc25Q3UA16 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Spc25Q3UA16 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spc25Q3UA16 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Spc25Q3UA16 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Spc25Q3UA16 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spc25Q3UA16 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spc25Q3UA16 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spc25Q3UA16 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spc25Q3UA16 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spc25Q3UA16 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spc25Q3UA16 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spc25Q3UA16 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spc25Q3UA16 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Spc25Q3UA16 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spc25Q3UA16 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spc25Q3UA16 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Spc25Q3UA16 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spc25Q3UA16 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Spc25Q3UA16 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Spc25Q3UA16 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spc25Q3UA16 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Spc25Q3UA16 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spc25Q3UA16 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Spc25Q3UA16 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spc25Q3UA16 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Spc25Q3UA16 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spc25Q3UA16 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spc25Q3UA16 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spc25Q3UA16 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spc25Q3UA16 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Spc25Q3UA16 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spc25Q3UA16 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spc25Q3UA16 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spc25Q3UA16 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spc25Q3UA16 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spc25Q3UA16 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spc25Q3UA16 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Spc25Q3UA16 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spc25Q3UA16 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spc25Q3UA16 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spc25Q3UA16 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spc25Q3UA16 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Spc25Q3UA16 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spc25Q3UA16 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spc25Q3UA16 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spc25Q3UA16 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spc25Q3UA16 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spc25Q3UA16 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spc25Q3UA16 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spc25Q3UA16 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spc25Q3UA16 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spc25Q3UA16 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spc25Q3UA16 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spc25Q3UA16 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spc25Q3UA16 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spc25Q3UA16 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spc25Q3UA16 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Spc25Q3UA16 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spc25Q3UA16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spc25Q3UA16 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spc25Q3UA16 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spc25Q3UA16 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spc25Q3UA16 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Spc25Q3UA16 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Spc25Q3UA16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spc25Q3UA16 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Spc25Q3UA16 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spc25Q3UA16 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spc25Q3UA16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spc25Q3UA16 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spc25Q3UA16 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spc25Q3UA16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spc25Q3UA16 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spc25Q3UA16 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spc25Q3UA16 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spc25Q3UA16 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spc25Q3UA16 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spc25Q3UA16 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spc25Q3UA16 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spc25Q3UA16 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spc25Q3UA16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spc25Q3UA16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spc25Q3UA16 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spc25Q3UA16 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spc25Q3UA16 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spc25Q3UA16 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spc25Q3UA16 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spc25Q3UA16 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spc25Q3UA16 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spc25Q3UA16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spc25Q3UA16 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spc25Q3UA16 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spc25Q3UA16 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms