Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Casq2O09161 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Casq2O09161 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Casq2O09161 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Casq2O09161 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Casq2O09161 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Casq2O09161 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Casq2O09161 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Casq2O09161 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Casq2O09161 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Casq2O09161 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Casq2O09161 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Casq2O09161 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Casq2O09161 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Casq2O09161 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Casq2O09161 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Casq2O09161 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Casq2O09161 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Casq2O09161 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Casq2O09161 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Casq2O09161 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Casq2O09161 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Casq2O09161 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Casq2O09161 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Casq2O09161 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Casq2O09161 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Casq2O09161 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Casq2O09161 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Casq2O09161 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Casq2O09161 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Casq2O09161 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Casq2O09161 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Casq2O09161 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Casq2O09161 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Casq2O09161 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Casq2O09161 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Casq2O09161 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Casq2O09161 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Casq2O09161 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Casq2O09161 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Casq2O09161 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Casq2O09161 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casq2O09161 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Casq2O09161 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Casq2O09161 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Casq2O09161 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Casq2O09161 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Casq2O09161 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casq2O09161 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Casq2O09161 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Casq2O09161 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Casq2O09161 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casq2O09161 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Casq2O09161 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Casq2O09161 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Casq2O09161 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Casq2O09161 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Casq2O09161 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Casq2O09161 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Casq2O09161 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Casq2O09161 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Casq2O09161 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Casq2O09161 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Casq2O09161 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casq2O09161 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casq2O09161 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Casq2O09161 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casq2O09161 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casq2O09161 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casq2O09161 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casq2O09161 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casq2O09161 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Casq2O09161 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casq2O09161 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Casq2O09161 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casq2O09161 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casq2O09161 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casq2O09161 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Casq2O09161 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Casq2O09161 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Casq2O09161 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Casq2O09161 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Casq2O09161 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Casq2O09161 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Casq2O09161 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Casq2O09161 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casq2O09161 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Casq2O09161 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Casq2O09161 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casq2O09161 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casq2O09161 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casq2O09161 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casq2O09161 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casq2O09161 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casq2O09161 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casq2O09161 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casq2O09161 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casq2O09161 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casq2O09161 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casq2O09161 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms