Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Casq2O09161 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Casq2O09161 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Casq2O09161 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
Casq2O09161 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,26■■■□□ 2,92
Casq2O09161 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Casq2O09161 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Casq2O09161 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Casq2O09161 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Casq2O09161 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Casq2O09161 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Casq2O09161 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Casq2O09161 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Casq2O09161 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Casq2O09161 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Casq2O09161 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Casq2O09161 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Casq2O09161 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Casq2O09161 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Casq2O09161 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Casq2O09161 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Casq2O09161 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Casq2O09161 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Casq2O09161 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Casq2O09161 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Casq2O09161 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Casq2O09161 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Casq2O09161 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Casq2O09161 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Casq2O09161 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Casq2O09161 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Casq2O09161 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Casq2O09161 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Casq2O09161 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Casq2O09161 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Casq2O09161 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Casq2O09161 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Casq2O09161 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Casq2O09161 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Casq2O09161 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Casq2O09161 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Casq2O09161 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Casq2O09161 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Casq2O09161 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Casq2O09161 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Casq2O09161 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Casq2O09161 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Casq2O09161 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Casq2O09161 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Casq2O09161 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Casq2O09161 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Casq2O09161 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Casq2O09161 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Casq2O09161 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Casq2O09161 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Casq2O09161 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Casq2O09161 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Casq2O09161 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Casq2O09161 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Casq2O09161 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Casq2O09161 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Casq2O09161 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Casq2O09161 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Casq2O09161 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Casq2O09161 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Casq2O09161 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Casq2O09161 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Casq2O09161 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Casq2O09161 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Casq2O09161 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Casq2O09161 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Casq2O09161 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Casq2O09161 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Casq2O09161 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Casq2O09161 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Casq2O09161 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Casq2O09161 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Casq2O09161 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Casq2O09161 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Casq2O09161 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Casq2O09161 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Casq2O09161 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Casq2O09161 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Casq2O09161 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Casq2O09161 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Casq2O09161 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Casq2O09161 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Casq2O09161 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Casq2O09161 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Casq2O09161 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Casq2O09161 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Casq2O09161 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Casq2O09161 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Casq2O09161 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Casq2O09161 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Casq2O09161 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Casq2O09161 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Casq2O09161 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Casq2O09161 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Casq2O09161 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
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