Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Z9

Gfpt2, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 2, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Gfpt2Q9Z2Z9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Gfpt2Q9Z2Z9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Gfpt2Q9Z2Z9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Gfpt2Q9Z2Z9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Gfpt2Q9Z2Z9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Gfpt2Q9Z2Z9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Gfpt2Q9Z2Z9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Gfpt2Q9Z2Z9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gfpt2Q9Z2Z9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Gfpt2Q9Z2Z9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Gfpt2Q9Z2Z9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gfpt2Q9Z2Z9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gfpt2Q9Z2Z9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gfpt2Q9Z2Z9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Gfpt2Q9Z2Z9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gfpt2Q9Z2Z9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gfpt2Q9Z2Z9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Gfpt2Q9Z2Z9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gfpt2Q9Z2Z9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gfpt2Q9Z2Z9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gfpt2Q9Z2Z9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gfpt2Q9Z2Z9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gfpt2Q9Z2Z9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Gfpt2Q9Z2Z9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gfpt2Q9Z2Z9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gfpt2Q9Z2Z9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gfpt2Q9Z2Z9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gfpt2Q9Z2Z9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gfpt2Q9Z2Z9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gfpt2Q9Z2Z9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gfpt2Q9Z2Z9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gfpt2Q9Z2Z9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gfpt2Q9Z2Z9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Gfpt2Q9Z2Z9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gfpt2Q9Z2Z9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gfpt2Q9Z2Z9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Gfpt2Q9Z2Z9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gfpt2Q9Z2Z9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gfpt2Q9Z2Z9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Gfpt2Q9Z2Z9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Gfpt2Q9Z2Z9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Gfpt2Q9Z2Z9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gfpt2Q9Z2Z9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gfpt2Q9Z2Z9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gfpt2Q9Z2Z9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gfpt2Q9Z2Z9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gfpt2Q9Z2Z9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gfpt2Q9Z2Z9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gfpt2Q9Z2Z9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Gfpt2Q9Z2Z9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gfpt2Q9Z2Z9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Gfpt2Q9Z2Z9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gfpt2Q9Z2Z9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gfpt2Q9Z2Z9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gfpt2Q9Z2Z9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gfpt2Q9Z2Z9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Gfpt2Q9Z2Z9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gfpt2Q9Z2Z9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gfpt2Q9Z2Z9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gfpt2Q9Z2Z9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Gfpt2Q9Z2Z9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Gfpt2Q9Z2Z9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gfpt2Q9Z2Z9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gfpt2Q9Z2Z9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gfpt2Q9Z2Z9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gfpt2Q9Z2Z9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gfpt2Q9Z2Z9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gfpt2Q9Z2Z9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gfpt2Q9Z2Z9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gfpt2Q9Z2Z9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gfpt2Q9Z2Z9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gfpt2Q9Z2Z9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gfpt2Q9Z2Z9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gfpt2Q9Z2Z9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gfpt2Q9Z2Z9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gfpt2Q9Z2Z9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gfpt2Q9Z2Z9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gfpt2Q9Z2Z9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gfpt2Q9Z2Z9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gfpt2Q9Z2Z9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gfpt2Q9Z2Z9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gfpt2Q9Z2Z9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gfpt2Q9Z2Z9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gfpt2Q9Z2Z9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gfpt2Q9Z2Z9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gfpt2Q9Z2Z9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gfpt2Q9Z2Z9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gfpt2Q9Z2Z9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gfpt2Q9Z2Z9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms