RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ESYT3A0FGR9 886 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 H3BM21 787 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TSPAN6O43657 245 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 AP1G1O43747 822 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NDST3O95803 873 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 AGTP01019 485 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CSF2P04141 144 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 UGT2B4P06133 528 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MLNP12872 115 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-DPA1P20036 260 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ADRA1AP35348 466 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ABL2P42684 1182 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 RABIFP47224 123 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NPY2RP49146 381 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ARL4CP56559 192 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CDH17Q12864 832 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TRAF2Q12933 501 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SPARCL1Q14515 664 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CDKN3Q16667 212 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 WDR93Q6P2C0 686 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 RANBP10Q6VN20 620 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PARGQ86W56 976 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PDIK1LQ8N165 341 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 IFI44Q8TCB0 444 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MAPK15Q8TD08 544 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ARNT2Q9HBZ2 717 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BFARQ9NZS9 450 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DKK3Q9UBP4 350 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GGT7Q9UJ14 662 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CHKBQ9Y259 395 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ACACAQ13085 2346 aa11.32□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CPED1A4D0V7 1026 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 AQP9O43315 295 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 USP12O75317 370 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PPFIA2O75334 1257 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CSO75390 466 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PGLSO95336 258 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PIGNO95427 931 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FGF1P05230 155 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GP1BAP07359 652 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NME1P15531 152 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 JUNDP17535 347 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TNFRSF8P28908 595 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CARSP49589 748 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SUOXP51687 545 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 THOP1P52888 689 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GABREP78334 506 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LAMB3Q13751 1172 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 IHHQ14623 411 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TRADDQ15628 312 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SLC1A5Q15758 541 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 OR52K1Q8NGK4 314 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 LMX1AQ8TE12 382 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 RAB7BQ96AH8 199 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CASS4Q9NQ75 786 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GPR27Q9NS67 375 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 U3KQA8 63 aa11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.3□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms