RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493854.5

RABGAP1-212, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGAP1, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-212ENST00000493854 SNX4O95219 450 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 DEXIO95424 95 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TDP2O95551 362 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 AVPR2P30518 371 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CASQ1P31415 396 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SFNP31947 248 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 HTR7P34969 479 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 HNF1BP35680 557 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PLA2G5P39877 138 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 GZMKP49863 264 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PMS2P54278 862 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CLRN1P58418 232 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PRKCQQ04759 706 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ZBTB16Q05516 673 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ZP2Q05996 745 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CCNIQ14094 377 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 Q4G0T1 1027 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 JADE1Q6IE81 842 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ADCK2Q7Z695 626 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM110Q86TL2 294 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ABI1Q8IZP0 508 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 BLIDQ8IZY5 108 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PLD5Q8N7P1 536 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 RNF169Q8NCN4 708 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ALG3Q92685 438 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 NPAS1Q99742 590 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TLE6Q9H808 572 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 VAV3Q9UKW4 847 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 RAD54BQ9Y620 910 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CDHR4A6H8M9 788 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM150BA6NC51 233 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PER2O15055 1255 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ADAMDEC1O15204 470 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 DIAPH2O60879 1101 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PALMO75781 387 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SFTPCP11686 197 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SRCP12931 536 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 UQCRC1P31930 480 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CAPZA1P52907 286 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ERVFC1P60507 584 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ERVFRD-1P60508 538 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 YPEL5P62699 121 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM189BP81408 668 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 LMAN2Q12907 356 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 IKZF1Q13422 519 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 LAPTM4AQ15012 233 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 XKR3Q5GH77 459 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 RNF43Q68DV7 783 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGAP1-212ENST00000493854 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.5 ms