RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.01□□□□□ -1.29
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SHQ1-207ENST00000475558 PATE3B3GLJ2 98 aa7□□□□□ -1.29
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SHQ1-207ENST00000475558 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 K7ERQ8 282 aa7□□□□□ -1.29
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SHQ1-207ENST00000475558 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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SHQ1-207ENST00000475558 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
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SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7□□□□□ -1.29
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SHQ1-207ENST00000475558 TIMP2P16035 220 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 ENGP17813 658 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 ITGALP20701 1170 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 BCKDHBP21953 392 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 ITGB7P26010 798 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 NMBRP28336 390 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-207ENST00000475558 TYK2P29597 1187 aa6.99□□□□□ -1.29
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