RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CHST12Q9NRB3 414 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NPAP1Q9NZP6 1156 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHA4Q9UN74 947 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TMX2Q9Y320 296 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 RCN3Q96D15 328 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF404Q494X3 552 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PARP8Q8N3A8 854 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RAD18Q9NS91 495 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 CDH9Q9ULB4 789 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PRRT4C9JH25 899 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 MC2RQ01718 297 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 MTM1Q13496 603 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PTPAQ15257 358 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 DDR2Q16832 855 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 TIMM29Q9BSF4 260 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-209ENST00000442510 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 WASF3Q9UPY6 502 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CPED1A4D0V7 1026 aa5.57□□□□□ -1.52
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