RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 GABRDO14764 452 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 SLC16A6O15403 523 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 SEMG1P04279 462 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 MMP2P08253 660 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 CDKN2DP55273 166 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ESRRGP62508 458 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 HERVK_113P63132 956 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 PHC1P78364 1004 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 SP4Q02446 784 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 TNFAIP2Q03169 654 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 FCGR1AP12314 374 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 AVPR1AP37288 418 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 BFARQ9NZS9 450 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 IFT52Q9Y366 437 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 A0A1W2PP18 115 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 CLOCKO15516 846 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 KCNH1O95259 989 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ZBTB7AO95365 584 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 SLC26A2P50443 739 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF691Q5VV52 312 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 BIRC7Q96CA5 298 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 EGLN2Q96KS0 407 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 SP140LQ9H930 580 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 CLDN25C9JDP6 229 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 MAFKO60675 156 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 KPNA6O60684 536 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 NPPAP01160 153 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 KRT19P08727 400 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 GSSP48637 474 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 CTBP1Q13363 440 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 HHIPQ96QV1 700 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 SIAEQ9HAT2 523 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 POLG2Q9UHN1 485 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 TIMM22Q9Y584 194 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXB4-201ENST00000332503 UBXN8O00124 270 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 FDXRP22570 491 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 RYKP34925 604 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ACADSBP45954 432 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF846Q147U1 533 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SNX17Q15036 470 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC126Q96EE4 140 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 DUSP21Q9H596 190 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 AIG1Q9NVV5 245 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CD1DP15813 335 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 STMN1P16949 149 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 RCVRNP35243 200 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ETV6P41212 452 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TRAF2Q12933 501 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 OSTM1Q86WC4 334 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ATP1A4Q13733 1029 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 LAMC2Q13753 1193 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB4-201ENST00000332503 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms