RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 CASQ1P31415 396 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RFC2P35250 354 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAGEA1P43355 309 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 HSPA7P48741 367 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DGKEP52429 567 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 COPAP53621 1224 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GSCP56915 257 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GNG11P61952 73 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNNC1P63316 161 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CXADRP78310 365 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM189BP81408 668 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RBP5P82980 135 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 BEX3Q00994 111 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDR2Q01850 454 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT17Q04695 432 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITIH3Q06033 890 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MGAT3Q09327 533 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 INCA1Q0VD86 236 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRIK3Q13003 919 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITGA7Q13683 1181 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 E2F2Q14209 437 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 STARD3Q14849 445 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTGISQ16647 500 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MPEG1Q2M385 716 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 XKR4Q5GH76 650 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MZT2AQ6P582 158 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CXCL17Q6UXB2 119 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 UNC93AQ86WB7 457 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 Q8N1X5 172 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM86AQ8N2M4 240 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CEP112Q8N8E3 955 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MNS1Q8NEH6 495 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 POF1BQ8WVV4 589 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SNX19Q92543 992 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PKNOX2Q96KN3 472 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 COQ10AQ96MF6 247 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYT11Q9BT88 431 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MTMR12Q9C0I1 747 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ISCUQ9H1K1 167 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MINDY3Q9H8M7 445 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 STK39Q9UEW8 545 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MID2Q9UJV3 735 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GTF3C4Q9UKN8 822 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NENFQ9UMX5 172 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 JRKLQ9Y4A0 524 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM17Q9Y577 477 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYOFQ9NZM1 2061 aa3.56□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTPRJQ12913 1337 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A087WV62 115 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A087X0T9 212 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 A0A0U1RQF3 1178 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PIPSLA2A3N6 862 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAB27BO00194 218 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCLK1O15075 740 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 B4GALT5O43286 388 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 COQ9O75208 318 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 EDN1P05305 212 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms