RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566336.5

NAE1-215, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 5

Gene NAE1, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-215	ENST00000566336	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SCN1A	P35498	2009 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336		A6NNZ2	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	MASP2	O00187	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PIR	O00625	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SLC31A1	O15431	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	EDIL3	O43854	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CRLF1	O75462	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SLITRK3	O94933	977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	TDP2	O95551	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	MX1	P20591	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	C5AR1	P21730	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	DNASE1	P24855	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CHKA	P35790	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	DLST	P36957	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	STAT5A	P42229	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CASP2	P42575	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PSMD8	P48556	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	TUB	P50607	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	DGKQ	P52824	942 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	FZD2	Q14332	565 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336		Q6ZSR6	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PIM3	Q86V86	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ESX1	Q8N693	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	RHOV	Q96L33	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	YY2	O15391	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SLC7A4	O43246	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	GREM1	O60565	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	LYPLA2	O95372	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SLPI	P03973	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CLTA	P09496	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PRLR	P16471	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CYP3A7	P24462	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	YWHAQ	P27348	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PBX1	P40424	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	NEK3	P51956	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	C1orf61	Q13536	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAE1-215	ENST00000566336	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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