RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Myo1dQ5SYD0 1006 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MafkQ61827 156 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Capn3Q64691 821 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clip4Q8CI96 704 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MrgpreQ91ZB7 310 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nrif1Q923B3 828 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Smpd3Q9JJY3 655 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SufuQ9Z0P7 484 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RecqlQ9Z129 648 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem265E9Q8G3 109 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Matn2O08746 956 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Irs1P35569 1233 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Galnt3P70419 633 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hrh2P97292 397 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kcnc2Q14B80 642 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rbm44Q3V089 1013 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Paqr6Q6TCG5 343 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tas2r131Q7M708 310 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fstl5Q8BFR2 847 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ftsj1Q8CBC7 324 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc66Q8K0B3 872 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Snapc1Q8K0S9 389 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1353Q8VGU8 309 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Imp4Q8VHZ7 291 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hkdc1Q91W97 915 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Spatc1lQ9D9W0 342 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kat2bQ9JHD1 813 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cngb3Q9JJZ9 694 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 HephQ9Z0Z4 1157 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Stk25Q9Z2W1 426 aa8.5□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Armt1A6H630 439 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf518bB2RRE4 1077 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm8879F6R3J9 157 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CtsdP18242 410 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PgfP49764 158 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp2a12P56593 492 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mapk1P63085 358 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Krt80Q0VBK2 452 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Akap14Q3V0I7 536 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gata6Q61169 589 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nlrp9cQ66X01 1004 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc25a24Q8BMD8 475 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm5591Q8CDK1 855 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mrps18aQ99N85 196 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Marc1Q9CW42 340 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 P2yr13Q9D8I2 337 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Syde1Q9DBZ9 737 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndst3Q9EQH7 873 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cmtm7Q9ESD6 167 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sae1Q9R1T2 350 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SisF8VQM5 1818 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gbp4A4UUI3 631 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ssxb8B1AY40 170 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm11239E9Q5Z9 360 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm11237F2Z3W5 360 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm11238F2Z478 360 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Speer4cG3UXD1 256 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm10354K7N6A0 256 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm428Q3UTE2 360 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Spata48Q5NC83 441 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tnfaip2Q61333 691 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bcl2l1Q64373 233 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Galnt10Q6P9S7 603 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dnajc16Q80TN4 772 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tdp2Q9JJX7 370 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ap3m1Q9JKC8 418 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r76F8VQ63 324 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nsmce4aG3XA30 381 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AmacrO09174 381 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Akt1P31750 480 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q3UK37 420 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr464Q5SW48 313 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc6a3Q61327 619 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AtminQ6P9S1 818 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clec4b1Q7TS58 209 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ZfatQ7TS63 1237 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pqlc1Q80XM9 271 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ToporsQ80Z37 1033 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Insig1Q8BGI3 259 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DseQ8BLI4 958 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mterf4Q8BVN4 346 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnf208Q8K0W3 265 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr449Q8VGW8 311 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rsph1Q8VIG3 301 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam83dQ9D7I8 585 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp2c55Q9D816 490 aa8.49□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.4 ms