Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
DseQ8BLI4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DseQ8BLI4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
DseQ8BLI4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DseQ8BLI4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DseQ8BLI4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
DseQ8BLI4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
DseQ8BLI4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DseQ8BLI4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
DseQ8BLI4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DseQ8BLI4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
DseQ8BLI4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DseQ8BLI4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
DseQ8BLI4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
DseQ8BLI4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
DseQ8BLI4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DseQ8BLI4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DseQ8BLI4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DseQ8BLI4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DseQ8BLI4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DseQ8BLI4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DseQ8BLI4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DseQ8BLI4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DseQ8BLI4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DseQ8BLI4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DseQ8BLI4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DseQ8BLI4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DseQ8BLI4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
DseQ8BLI4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DseQ8BLI4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DseQ8BLI4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DseQ8BLI4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DseQ8BLI4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DseQ8BLI4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DseQ8BLI4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DseQ8BLI4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DseQ8BLI4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DseQ8BLI4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DseQ8BLI4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DseQ8BLI4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DseQ8BLI4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DseQ8BLI4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DseQ8BLI4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DseQ8BLI4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DseQ8BLI4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DseQ8BLI4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DseQ8BLI4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DseQ8BLI4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DseQ8BLI4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DseQ8BLI4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DseQ8BLI4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DseQ8BLI4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DseQ8BLI4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DseQ8BLI4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DseQ8BLI4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DseQ8BLI4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DseQ8BLI4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DseQ8BLI4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DseQ8BLI4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DseQ8BLI4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DseQ8BLI4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DseQ8BLI4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DseQ8BLI4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DseQ8BLI4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DseQ8BLI4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DseQ8BLI4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DseQ8BLI4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DseQ8BLI4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DseQ8BLI4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DseQ8BLI4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DseQ8BLI4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DseQ8BLI4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DseQ8BLI4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DseQ8BLI4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DseQ8BLI4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DseQ8BLI4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DseQ8BLI4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DseQ8BLI4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DseQ8BLI4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DseQ8BLI4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DseQ8BLI4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DseQ8BLI4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DseQ8BLI4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DseQ8BLI4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DseQ8BLI4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DseQ8BLI4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DseQ8BLI4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DseQ8BLI4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DseQ8BLI4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DseQ8BLI4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DseQ8BLI4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DseQ8BLI4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DseQ8BLI4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DseQ8BLI4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DseQ8BLI4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DseQ8BLI4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DseQ8BLI4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DseQ8BLI4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DseQ8BLI4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DseQ8BLI4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms