Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Nrif1Q923B3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nrif1Q923B3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nrif1Q923B3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nrif1Q923B3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nrif1Q923B3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Nrif1Q923B3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Nrif1Q923B3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Nrif1Q923B3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Nrif1Q923B3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nrif1Q923B3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nrif1Q923B3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Nrif1Q923B3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Nrif1Q923B3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nrif1Q923B3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nrif1Q923B3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Nrif1Q923B3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Nrif1Q923B3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nrif1Q923B3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nrif1Q923B3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nrif1Q923B3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nrif1Q923B3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nrif1Q923B3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nrif1Q923B3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nrif1Q923B3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nrif1Q923B3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Nrif1Q923B3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nrif1Q923B3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nrif1Q923B3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nrif1Q923B3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nrif1Q923B3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nrif1Q923B3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nrif1Q923B3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Nrif1Q923B3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nrif1Q923B3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nrif1Q923B3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nrif1Q923B3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nrif1Q923B3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nrif1Q923B3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nrif1Q923B3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nrif1Q923B3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nrif1Q923B3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nrif1Q923B3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nrif1Q923B3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nrif1Q923B3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nrif1Q923B3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nrif1Q923B3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nrif1Q923B3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nrif1Q923B3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nrif1Q923B3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nrif1Q923B3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nrif1Q923B3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nrif1Q923B3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nrif1Q923B3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nrif1Q923B3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nrif1Q923B3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nrif1Q923B3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nrif1Q923B3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nrif1Q923B3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrif1Q923B3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nrif1Q923B3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nrif1Q923B3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nrif1Q923B3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nrif1Q923B3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nrif1Q923B3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nrif1Q923B3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrif1Q923B3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrif1Q923B3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nrif1Q923B3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nrif1Q923B3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nrif1Q923B3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrif1Q923B3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrif1Q923B3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nrif1Q923B3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrif1Q923B3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrif1Q923B3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrif1Q923B3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nrif1Q923B3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrif1Q923B3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrif1Q923B3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nrif1Q923B3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nrif1Q923B3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nrif1Q923B3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nrif1Q923B3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nrif1Q923B3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nrif1Q923B3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nrif1Q923B3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nrif1Q923B3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nrif1Q923B3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nrif1Q923B3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nrif1Q923B3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nrif1Q923B3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nrif1Q923B3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nrif1Q923B3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nrif1Q923B3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nrif1Q923B3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nrif1Q923B3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nrif1Q923B3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nrif1Q923B3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nrif1Q923B3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms