Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Capn3Q64691 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Capn3Q64691 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Capn3Q64691 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Capn3Q64691 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Capn3Q64691 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Capn3Q64691 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Capn3Q64691 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Capn3Q64691 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Capn3Q64691 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Capn3Q64691 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Capn3Q64691 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Capn3Q64691 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Capn3Q64691 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Capn3Q64691 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Capn3Q64691 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Capn3Q64691 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Capn3Q64691 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Capn3Q64691 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Capn3Q64691 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Capn3Q64691 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Capn3Q64691 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Capn3Q64691 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Capn3Q64691 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Capn3Q64691 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Capn3Q64691 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Capn3Q64691 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Capn3Q64691 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Capn3Q64691 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Capn3Q64691 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Capn3Q64691 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Capn3Q64691 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Capn3Q64691 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Capn3Q64691 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Capn3Q64691 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Capn3Q64691 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Capn3Q64691 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Capn3Q64691 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Capn3Q64691 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Capn3Q64691 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Capn3Q64691 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Capn3Q64691 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Capn3Q64691 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Capn3Q64691 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Capn3Q64691 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Capn3Q64691 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Capn3Q64691 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Capn3Q64691 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Capn3Q64691 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Capn3Q64691 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Capn3Q64691 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Capn3Q64691 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Capn3Q64691 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Capn3Q64691 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Capn3Q64691 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Capn3Q64691 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Capn3Q64691 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Capn3Q64691 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn3Q64691 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capn3Q64691 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Capn3Q64691 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn3Q64691 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn3Q64691 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn3Q64691 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Capn3Q64691 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Capn3Q64691 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Capn3Q64691 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Capn3Q64691 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Capn3Q64691 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Capn3Q64691 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Capn3Q64691 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn3Q64691 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capn3Q64691 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Capn3Q64691 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn3Q64691 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Capn3Q64691 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn3Q64691 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Capn3Q64691 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Capn3Q64691 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn3Q64691 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn3Q64691 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Capn3Q64691 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Capn3Q64691 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Capn3Q64691 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Capn3Q64691 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Capn3Q64691 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn3Q64691 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn3Q64691 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn3Q64691 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Capn3Q64691 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Capn3Q64691 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Capn3Q64691 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn3Q64691 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Capn3Q64691 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Capn3Q64691 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Capn3Q64691 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Capn3Q64691 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capn3Q64691 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Capn3Q64691 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Capn3Q64691 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms