Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Vmn1r76F8VQ63 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Vmn1r76F8VQ63 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Vmn1r76F8VQ63 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Vmn1r76F8VQ63 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Vmn1r76F8VQ63 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Vmn1r76F8VQ63 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Vmn1r76F8VQ63 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Vmn1r76F8VQ63 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Vmn1r76F8VQ63 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Vmn1r76F8VQ63 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Vmn1r76F8VQ63 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Vmn1r76F8VQ63 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Vmn1r76F8VQ63 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Vmn1r76F8VQ63 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Vmn1r76F8VQ63 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Vmn1r76F8VQ63 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Vmn1r76F8VQ63 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vmn1r76F8VQ63 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vmn1r76F8VQ63 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Vmn1r76F8VQ63 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vmn1r76F8VQ63 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vmn1r76F8VQ63 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Vmn1r76F8VQ63 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vmn1r76F8VQ63 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Vmn1r76F8VQ63 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Vmn1r76F8VQ63 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Vmn1r76F8VQ63 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vmn1r76F8VQ63 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Vmn1r76F8VQ63 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Vmn1r76F8VQ63 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Vmn1r76F8VQ63 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Vmn1r76F8VQ63 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vmn1r76F8VQ63 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Vmn1r76F8VQ63 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Vmn1r76F8VQ63 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vmn1r76F8VQ63 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vmn1r76F8VQ63 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Vmn1r76F8VQ63 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Vmn1r76F8VQ63 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vmn1r76F8VQ63 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Vmn1r76F8VQ63 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Vmn1r76F8VQ63 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vmn1r76F8VQ63 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vmn1r76F8VQ63 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vmn1r76F8VQ63 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vmn1r76F8VQ63 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vmn1r76F8VQ63 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vmn1r76F8VQ63 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vmn1r76F8VQ63 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Vmn1r76F8VQ63 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Vmn1r76F8VQ63 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Vmn1r76F8VQ63 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vmn1r76F8VQ63 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vmn1r76F8VQ63 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Vmn1r76F8VQ63 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vmn1r76F8VQ63 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vmn1r76F8VQ63 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vmn1r76F8VQ63 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vmn1r76F8VQ63 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vmn1r76F8VQ63 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Vmn1r76F8VQ63 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vmn1r76F8VQ63 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vmn1r76F8VQ63 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vmn1r76F8VQ63 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vmn1r76F8VQ63 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Vmn1r76F8VQ63 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Vmn1r76F8VQ63 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vmn1r76F8VQ63 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vmn1r76F8VQ63 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vmn1r76F8VQ63 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Vmn1r76F8VQ63 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vmn1r76F8VQ63 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vmn1r76F8VQ63 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn1r76F8VQ63 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn1r76F8VQ63 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vmn1r76F8VQ63 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vmn1r76F8VQ63 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vmn1r76F8VQ63 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vmn1r76F8VQ63 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vmn1r76F8VQ63 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn1r76F8VQ63 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vmn1r76F8VQ63 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vmn1r76F8VQ63 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vmn1r76F8VQ63 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vmn1r76F8VQ63 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vmn1r76F8VQ63 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn1r76F8VQ63 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn1r76F8VQ63 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vmn1r76F8VQ63 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vmn1r76F8VQ63 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vmn1r76F8VQ63 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vmn1r76F8VQ63 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vmn1r76F8VQ63 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms