Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Vmn1r76F8VQ63 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Vmn1r76F8VQ63 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Vmn1r76F8VQ63 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Vmn1r76F8VQ63 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Vmn1r76F8VQ63 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Vmn1r76F8VQ63 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
Vmn1r76F8VQ63 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Vmn1r76F8VQ63 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Vmn1r76F8VQ63 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Vmn1r76F8VQ63 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Vmn1r76F8VQ63 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,15■■■□□ 2,58
Vmn1r76F8VQ63 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Vmn1r76F8VQ63 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Vmn1r76F8VQ63 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Vmn1r76F8VQ63 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Vmn1r76F8VQ63 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Vmn1r76F8VQ63 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Vmn1r76F8VQ63 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Vmn1r76F8VQ63 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Vmn1r76F8VQ63 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Vmn1r76F8VQ63 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Vmn1r76F8VQ63 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Vmn1r76F8VQ63 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Vmn1r76F8VQ63 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Vmn1r76F8VQ63 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Vmn1r76F8VQ63 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Vmn1r76F8VQ63 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Vmn1r76F8VQ63 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Vmn1r76F8VQ63 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Vmn1r76F8VQ63 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Vmn1r76F8VQ63 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Vmn1r76F8VQ63 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Vmn1r76F8VQ63 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Vmn1r76F8VQ63 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Vmn1r76F8VQ63 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Vmn1r76F8VQ63 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Vmn1r76F8VQ63 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Vmn1r76F8VQ63 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Vmn1r76F8VQ63 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Vmn1r76F8VQ63 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Vmn1r76F8VQ63 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Vmn1r76F8VQ63 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vmn1r76F8VQ63 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Vmn1r76F8VQ63 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Vmn1r76F8VQ63 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Vmn1r76F8VQ63 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vmn1r76F8VQ63 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Vmn1r76F8VQ63 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Vmn1r76F8VQ63 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Vmn1r76F8VQ63 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Vmn1r76F8VQ63 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Vmn1r76F8VQ63 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Vmn1r76F8VQ63 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Vmn1r76F8VQ63 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Vmn1r76F8VQ63 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Vmn1r76F8VQ63 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Vmn1r76F8VQ63 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Vmn1r76F8VQ63 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Vmn1r76F8VQ63 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Vmn1r76F8VQ63 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Vmn1r76F8VQ63 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Vmn1r76F8VQ63 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Vmn1r76F8VQ63 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Vmn1r76F8VQ63 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Vmn1r76F8VQ63 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Vmn1r76F8VQ63 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Vmn1r76F8VQ63 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Vmn1r76F8VQ63 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Vmn1r76F8VQ63 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Vmn1r76F8VQ63 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Vmn1r76F8VQ63 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Vmn1r76F8VQ63 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Vmn1r76F8VQ63 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Vmn1r76F8VQ63 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Vmn1r76F8VQ63 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Vmn1r76F8VQ63 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Vmn1r76F8VQ63 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Vmn1r76F8VQ63 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Vmn1r76F8VQ63 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Vmn1r76F8VQ63 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Vmn1r76F8VQ63 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Vmn1r76F8VQ63 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Vmn1r76F8VQ63 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Vmn1r76F8VQ63 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Vmn1r76F8VQ63 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Vmn1r76F8VQ63 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Vmn1r76F8VQ63 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Vmn1r76F8VQ63 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Vmn1r76F8VQ63 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Vmn1r76F8VQ63 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Vmn1r76F8VQ63 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Vmn1r76F8VQ63 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Vmn1r76F8VQ63 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Vmn1r76F8VQ63 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Vmn1r76F8VQ63 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms