RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261947.4

RNF130-201, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF130, Length 1,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-201ENST00000261947 ALS2CLQ60I27 953 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 Q6ZS52 159 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 UNC5BQ8IZJ1 945 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 SYNPOQ8N3V7 929 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 TTC30BQ8N4P2 665 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 GPR63Q9BZJ6 419 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 FBRSQ9HAH7 460 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 LMAN1LQ9HAT1 526 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 CD248Q9HCU0 757 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 MMP17Q9ULZ9 603 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 A8MX80 341 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 XPAP23025 273 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 SEMG2Q02383 582 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 LRRC32Q14392 662 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 CST6Q15828 149 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 CDKN3Q16667 212 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 CYS1Q717R9 158 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 STYXQ8WUJ0 223 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 PEX13Q92968 403 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 DYRK4Q9NR20 520 aa27.4■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 SLC4A1P02730 911 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 LPOP22079 712 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 STX2P32856 288 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 PDE1BQ01064 536 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 PTPRCAPQ14761 206 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 CRTC1Q6UUV9 634 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 OR13J1Q8NGT2 312 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 NELL2Q99435 816 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 FOXQ1Q9C009 403 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 ACSS3Q9H6R3 686 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 PCDH12Q9NPG4 1184 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 B4GALT6Q9UBX8 382 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 RIMKLBQ9ULI2 386 aa27.39■■□□□ 1.98
RNF130-201ENST00000261947 ADH1BP00325 375 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 C1QAP02745 245 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 NFKBIAP25963 317 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 HMGCLP35914 325 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 FAM193AP78312 1265 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 FZD5Q13467 585 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 SKIDA1Q1XH10 827 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 FBXL19Q6PCT2 694 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 TSPAN33Q86UF1 283 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 CACUL1Q86Y37 369 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 OR13C4Q8NGS5 318 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 EID2BQ96D98 161 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 CERS2Q96G23 380 aa27.38■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 VCANP13611 3396 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 FAM170BA6NMN3 283 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 PLK4O00444 970 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 MID1O15344 667 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ATP8B1O43520 1251 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 CLDN7O95471 211 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 PAMP19021 973 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 RPS14P62263 151 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 IFFO1Q0D2I5 559 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 STAT4Q14765 748 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 LONRF1Q17RB8 773 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 TMEM92Q6UXU6 159 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 OR4K2Q8NGD2 314 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ZBTB9Q96C00 473 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 CCDC77Q9BR77 488 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 PIAS1O75925 651 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 VAPBO95292 243 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 LHCGRP22888 699 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ACVR1Q04771 509 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 LRIG3Q6UXM1 1119 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 TMPRSS6Q8IU80 811 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 CYTH2Q99418 400 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 HDAC8Q9BY41 377 aa27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 BPTFQ12830 3046 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ADRB3P13945 408 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 C5AR1P21730 350 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 ARNTP27540 789 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 NEK3P51956 506 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 TMPRSS15P98073 1019 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 CRY1Q16526 586 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 LRRC66Q68CR7 880 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 TBC1D17Q9HA65 648 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 IL17CQ9P0M4 197 aa27.36■■□□□ 1.97
RNF130-201ENST00000261947 SCN8AQ9UQD0 1980 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms