RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AasdhpptQ9CQF6 309 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zswim7Q9CWQ2 152 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RpainQ9CWY9 219 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mis12Q9CY25 206 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl8a6Q9DAY2 240 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpne8Q9DC53 577 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ParvaQ9EPC1 372 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc86Q9JJ89 426 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EmcnQ9R0H2 261 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slfn2Q9Z0I6 378 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ReckQ9Z0J1 971 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5538W4VSP6 401 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mast4Q811L6 2618 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vps13cQ8BX70 3748 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RelnQ60841 3461 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armt1A6H630 439 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cylc2B1AWN8 422 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp395E9Q5N9 508 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptar1E9QAB6 424 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgf10O35565 209 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd151O35566 253 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scamp3O35609 349 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nek2O35942 443 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01807 119 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a13P31649 602 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtskP55097 329 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aup1P70295 410 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp8a1P70704 1164 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Inf2Q0GNC1 1273 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc162pQ0VG85 912 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc38a5Q3U1J0 479 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lmf1Q3U3R4 574 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo7Q3U7U3 523 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hdhd2Q3UGR5 259 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fcrl5Q68SN8 596 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DdiasQ6NZG4 898 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc117Q6PB51 277 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asic3Q6X1Y6 530 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1057Q7TR75 315 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fnbp1Q80TY0 616 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slitrk4Q810B8 837 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspbap1Q8BK58 483 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ucn3Q924A4 164 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem30cQ9D4D7 342 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp3Q9D7X3 185 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ItpaQ9D892 198 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpv4Q9EPK8 871 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec2iQ9WVF9 217 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itpr3P70227 2670 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc39aA2ACP1 578 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lipo2D3YY49 398 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F6Y6L6 278 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp715G3X9T1 886 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MntO08789 591 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxd2O35392 492 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2afzP0C0S6 128 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpm1P58771 284 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdo1P60334 200 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chp1P61022 195 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RnaselQ05921 735 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A1bgQ19LI2 512 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2afvQ3THW5 128 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scrn3Q3TMH2 418 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf185Q62394 352 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3gl1Q62419 368 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp91Q62511 572 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dsg1bQ7TSF1 1060 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epn1Q80VP1 575 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Skida1Q80YR3 822 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam72aQ8BFZ8 149 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trmt12Q8BG71 446 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FicdQ8BIX9 458 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tarsl2Q8BLY2 790 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fra10ac1Q8BP78 315 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Camk1dQ8BW96 385 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc16Q8C1F5 767 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam110bQ8C739 366 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trip10Q8CJ53 603 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd6Q8K2J9 488 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc42Q8R2U7 421 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sp7Q8VI67 428 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgfrl1Q91V87 529 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tc2nQ91XT6 489 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rwdd4Q9CPR1 188 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf146Q9CZW6 359 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn22Q9D7U6 220 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csnk1dQ9DC28 415 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bace2Q9JL18 514 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.6 ms