Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,86■■■■□ 3,65
Dsg1bQ7TSF1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Dsg1bQ7TSF1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Dsg1bQ7TSF1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Dsg1bQ7TSF1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,36■■■□□ 2,93
Dsg1bQ7TSF1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Dsg1bQ7TSF1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Dsg1bQ7TSF1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Dsg1bQ7TSF1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,63■■■□□ 2,81
Dsg1bQ7TSF1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Dsg1bQ7TSF1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Dsg1bQ7TSF1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Dsg1bQ7TSF1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Dsg1bQ7TSF1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Dsg1bQ7TSF1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Dsg1bQ7TSF1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Dsg1bQ7TSF1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Dsg1bQ7TSF1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Dsg1bQ7TSF1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Dsg1bQ7TSF1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Dsg1bQ7TSF1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Dsg1bQ7TSF1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Dsg1bQ7TSF1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Dsg1bQ7TSF1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Dsg1bQ7TSF1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,67■■■□□ 2,5
Dsg1bQ7TSF1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Dsg1bQ7TSF1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Dsg1bQ7TSF1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Dsg1bQ7TSF1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Dsg1bQ7TSF1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Dsg1bQ7TSF1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Dsg1bQ7TSF1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Dsg1bQ7TSF1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Dsg1bQ7TSF1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Dsg1bQ7TSF1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Dsg1bQ7TSF1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Dsg1bQ7TSF1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Dsg1bQ7TSF1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Dsg1bQ7TSF1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Dsg1bQ7TSF1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Dsg1bQ7TSF1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Dsg1bQ7TSF1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Dsg1bQ7TSF1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Dsg1bQ7TSF1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Dsg1bQ7TSF1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Dsg1bQ7TSF1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Dsg1bQ7TSF1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Dsg1bQ7TSF1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Dsg1bQ7TSF1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Dsg1bQ7TSF1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Dsg1bQ7TSF1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Dsg1bQ7TSF1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Dsg1bQ7TSF1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Dsg1bQ7TSF1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Dsg1bQ7TSF1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Dsg1bQ7TSF1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Dsg1bQ7TSF1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Dsg1bQ7TSF1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Dsg1bQ7TSF1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Dsg1bQ7TSF1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Dsg1bQ7TSF1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Dsg1bQ7TSF1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Dsg1bQ7TSF1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Dsg1bQ7TSF1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Dsg1bQ7TSF1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Dsg1bQ7TSF1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Dsg1bQ7TSF1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Dsg1bQ7TSF1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Dsg1bQ7TSF1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Dsg1bQ7TSF1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Dsg1bQ7TSF1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Dsg1bQ7TSF1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Dsg1bQ7TSF1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Dsg1bQ7TSF1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Dsg1bQ7TSF1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Dsg1bQ7TSF1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Dsg1bQ7TSF1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Dsg1bQ7TSF1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Dsg1bQ7TSF1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Dsg1bQ7TSF1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Dsg1bQ7TSF1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Dsg1bQ7TSF1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Dsg1bQ7TSF1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Dsg1bQ7TSF1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Dsg1bQ7TSF1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Dsg1bQ7TSF1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Dsg1bQ7TSF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Dsg1bQ7TSF1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Dsg1bQ7TSF1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Dsg1bQ7TSF1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Dsg1bQ7TSF1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Dsg1bQ7TSF1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
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