Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
RpainQ9CWY9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RpainQ9CWY9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RpainQ9CWY9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RpainQ9CWY9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RpainQ9CWY9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RpainQ9CWY9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RpainQ9CWY9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RpainQ9CWY9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RpainQ9CWY9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
RpainQ9CWY9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
RpainQ9CWY9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RpainQ9CWY9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
RpainQ9CWY9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RpainQ9CWY9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RpainQ9CWY9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RpainQ9CWY9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RpainQ9CWY9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RpainQ9CWY9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RpainQ9CWY9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
RpainQ9CWY9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RpainQ9CWY9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RpainQ9CWY9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RpainQ9CWY9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RpainQ9CWY9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RpainQ9CWY9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RpainQ9CWY9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RpainQ9CWY9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RpainQ9CWY9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RpainQ9CWY9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RpainQ9CWY9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RpainQ9CWY9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RpainQ9CWY9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RpainQ9CWY9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RpainQ9CWY9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RpainQ9CWY9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RpainQ9CWY9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RpainQ9CWY9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RpainQ9CWY9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RpainQ9CWY9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RpainQ9CWY9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RpainQ9CWY9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RpainQ9CWY9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RpainQ9CWY9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RpainQ9CWY9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RpainQ9CWY9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RpainQ9CWY9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RpainQ9CWY9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RpainQ9CWY9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RpainQ9CWY9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
RpainQ9CWY9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RpainQ9CWY9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RpainQ9CWY9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RpainQ9CWY9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RpainQ9CWY9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RpainQ9CWY9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RpainQ9CWY9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RpainQ9CWY9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RpainQ9CWY9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RpainQ9CWY9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RpainQ9CWY9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RpainQ9CWY9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RpainQ9CWY9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RpainQ9CWY9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RpainQ9CWY9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RpainQ9CWY9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RpainQ9CWY9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RpainQ9CWY9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RpainQ9CWY9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RpainQ9CWY9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RpainQ9CWY9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RpainQ9CWY9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RpainQ9CWY9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RpainQ9CWY9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RpainQ9CWY9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RpainQ9CWY9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RpainQ9CWY9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RpainQ9CWY9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RpainQ9CWY9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RpainQ9CWY9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RpainQ9CWY9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RpainQ9CWY9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RpainQ9CWY9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RpainQ9CWY9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RpainQ9CWY9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RpainQ9CWY9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RpainQ9CWY9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RpainQ9CWY9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RpainQ9CWY9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RpainQ9CWY9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RpainQ9CWY9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RpainQ9CWY9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RpainQ9CWY9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RpainQ9CWY9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RpainQ9CWY9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RpainQ9CWY9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RpainQ9CWY9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RpainQ9CWY9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RpainQ9CWY9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RpainQ9CWY9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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