Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6I0

Vmn2r116, Vomeronasal type-2 receptor 116, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r116E9Q6I0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Vmn2r116E9Q6I0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Vmn2r116E9Q6I0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Vmn2r116E9Q6I0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Vmn2r116E9Q6I0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Vmn2r116E9Q6I0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Vmn2r116E9Q6I0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Vmn2r116E9Q6I0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Vmn2r116E9Q6I0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Vmn2r116E9Q6I0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Vmn2r116E9Q6I0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Vmn2r116E9Q6I0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Vmn2r116E9Q6I0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Vmn2r116E9Q6I0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Vmn2r116E9Q6I0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Vmn2r116E9Q6I0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Vmn2r116E9Q6I0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Vmn2r116E9Q6I0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Vmn2r116E9Q6I0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Vmn2r116E9Q6I0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Vmn2r116E9Q6I0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vmn2r116E9Q6I0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Vmn2r116E9Q6I0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Vmn2r116E9Q6I0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Vmn2r116E9Q6I0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Vmn2r116E9Q6I0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vmn2r116E9Q6I0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Vmn2r116E9Q6I0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vmn2r116E9Q6I0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Vmn2r116E9Q6I0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vmn2r116E9Q6I0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Vmn2r116E9Q6I0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Vmn2r116E9Q6I0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vmn2r116E9Q6I0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vmn2r116E9Q6I0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vmn2r116E9Q6I0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Vmn2r116E9Q6I0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vmn2r116E9Q6I0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Vmn2r116E9Q6I0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Vmn2r116E9Q6I0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Vmn2r116E9Q6I0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Vmn2r116E9Q6I0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Vmn2r116E9Q6I0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Vmn2r116E9Q6I0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Vmn2r116E9Q6I0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vmn2r116E9Q6I0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Vmn2r116E9Q6I0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Vmn2r116E9Q6I0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Vmn2r116E9Q6I0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Vmn2r116E9Q6I0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Vmn2r116E9Q6I0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Vmn2r116E9Q6I0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vmn2r116E9Q6I0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vmn2r116E9Q6I0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vmn2r116E9Q6I0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vmn2r116E9Q6I0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vmn2r116E9Q6I0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vmn2r116E9Q6I0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Vmn2r116E9Q6I0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vmn2r116E9Q6I0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vmn2r116E9Q6I0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vmn2r116E9Q6I0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vmn2r116E9Q6I0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Vmn2r116E9Q6I0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vmn2r116E9Q6I0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vmn2r116E9Q6I0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vmn2r116E9Q6I0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vmn2r116E9Q6I0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vmn2r116E9Q6I0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vmn2r116E9Q6I0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vmn2r116E9Q6I0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vmn2r116E9Q6I0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Vmn2r116E9Q6I0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vmn2r116E9Q6I0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Vmn2r116E9Q6I0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn2r116E9Q6I0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vmn2r116E9Q6I0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vmn2r116E9Q6I0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vmn2r116E9Q6I0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vmn2r116E9Q6I0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vmn2r116E9Q6I0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vmn2r116E9Q6I0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vmn2r116E9Q6I0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vmn2r116E9Q6I0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vmn2r116E9Q6I0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vmn2r116E9Q6I0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vmn2r116E9Q6I0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vmn2r116E9Q6I0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vmn2r116E9Q6I0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vmn2r116E9Q6I0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vmn2r116E9Q6I0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vmn2r116E9Q6I0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn2r116E9Q6I0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn2r116E9Q6I0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vmn2r116E9Q6I0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vmn2r116E9Q6I0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vmn2r116E9Q6I0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vmn2r116E9Q6I0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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