Protein–RNA interactions for Protein: Q0GNC1

Inf2, Inverted formin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Inf2Q0GNC1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
Inf2Q0GNC1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Inf2Q0GNC1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Inf2Q0GNC1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,7■■■□□ 2,83
Inf2Q0GNC1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
Inf2Q0GNC1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Inf2Q0GNC1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Inf2Q0GNC1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Inf2Q0GNC1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Inf2Q0GNC1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Inf2Q0GNC1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Inf2Q0GNC1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Inf2Q0GNC1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Inf2Q0GNC1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Inf2Q0GNC1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Inf2Q0GNC1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Inf2Q0GNC1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Inf2Q0GNC1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Inf2Q0GNC1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Inf2Q0GNC1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Inf2Q0GNC1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Inf2Q0GNC1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Inf2Q0GNC1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Inf2Q0GNC1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Inf2Q0GNC1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Inf2Q0GNC1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Inf2Q0GNC1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Inf2Q0GNC1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Inf2Q0GNC1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Inf2Q0GNC1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Inf2Q0GNC1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Inf2Q0GNC1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Inf2Q0GNC1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Inf2Q0GNC1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Inf2Q0GNC1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Inf2Q0GNC1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Inf2Q0GNC1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Inf2Q0GNC1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Inf2Q0GNC1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Inf2Q0GNC1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
Inf2Q0GNC1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Inf2Q0GNC1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Inf2Q0GNC1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Inf2Q0GNC1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Inf2Q0GNC1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Inf2Q0GNC1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Inf2Q0GNC1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Inf2Q0GNC1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Inf2Q0GNC1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Inf2Q0GNC1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Inf2Q0GNC1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Inf2Q0GNC1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Inf2Q0GNC1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Inf2Q0GNC1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Inf2Q0GNC1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Inf2Q0GNC1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Inf2Q0GNC1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Inf2Q0GNC1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Inf2Q0GNC1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Inf2Q0GNC1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Inf2Q0GNC1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Inf2Q0GNC1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Inf2Q0GNC1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Inf2Q0GNC1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Inf2Q0GNC1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Inf2Q0GNC1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Inf2Q0GNC1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Inf2Q0GNC1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Inf2Q0GNC1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Inf2Q0GNC1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Inf2Q0GNC1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Inf2Q0GNC1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Inf2Q0GNC1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Inf2Q0GNC1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Inf2Q0GNC1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Inf2Q0GNC1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Inf2Q0GNC1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Inf2Q0GNC1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Inf2Q0GNC1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Inf2Q0GNC1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Inf2Q0GNC1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Inf2Q0GNC1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Inf2Q0GNC1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Inf2Q0GNC1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Inf2Q0GNC1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Inf2Q0GNC1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Inf2Q0GNC1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Inf2Q0GNC1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Inf2Q0GNC1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Inf2Q0GNC1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Inf2Q0GNC1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,56■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,54■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Inf2Q0GNC1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Inf2Q0GNC1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Inf2Q0GNC1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Inf2Q0GNC1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Inf2Q0GNC1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms