Protein–RNA interactions for Protein: Q0GNC1

Inf2, Inverted formin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Inf2Q0GNC1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Inf2Q0GNC1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Inf2Q0GNC1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Inf2Q0GNC1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Inf2Q0GNC1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Inf2Q0GNC1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Inf2Q0GNC1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Inf2Q0GNC1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Inf2Q0GNC1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Inf2Q0GNC1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Inf2Q0GNC1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Inf2Q0GNC1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Inf2Q0GNC1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Inf2Q0GNC1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Inf2Q0GNC1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Inf2Q0GNC1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Inf2Q0GNC1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Inf2Q0GNC1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Inf2Q0GNC1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Inf2Q0GNC1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Inf2Q0GNC1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Inf2Q0GNC1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Inf2Q0GNC1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Inf2Q0GNC1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Inf2Q0GNC1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Inf2Q0GNC1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Inf2Q0GNC1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Inf2Q0GNC1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Inf2Q0GNC1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Inf2Q0GNC1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Inf2Q0GNC1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Inf2Q0GNC1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Inf2Q0GNC1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Inf2Q0GNC1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Inf2Q0GNC1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Inf2Q0GNC1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Inf2Q0GNC1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Inf2Q0GNC1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Inf2Q0GNC1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Inf2Q0GNC1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Inf2Q0GNC1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Inf2Q0GNC1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Inf2Q0GNC1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Inf2Q0GNC1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Inf2Q0GNC1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Inf2Q0GNC1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Inf2Q0GNC1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Inf2Q0GNC1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Inf2Q0GNC1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Inf2Q0GNC1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Inf2Q0GNC1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Inf2Q0GNC1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Inf2Q0GNC1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Inf2Q0GNC1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Inf2Q0GNC1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Inf2Q0GNC1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Inf2Q0GNC1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Inf2Q0GNC1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Inf2Q0GNC1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Inf2Q0GNC1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Inf2Q0GNC1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Inf2Q0GNC1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Inf2Q0GNC1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Inf2Q0GNC1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Inf2Q0GNC1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Inf2Q0GNC1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Inf2Q0GNC1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Inf2Q0GNC1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Inf2Q0GNC1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Inf2Q0GNC1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Inf2Q0GNC1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Inf2Q0GNC1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Inf2Q0GNC1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Inf2Q0GNC1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Inf2Q0GNC1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Inf2Q0GNC1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Inf2Q0GNC1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Inf2Q0GNC1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Inf2Q0GNC1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Inf2Q0GNC1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Inf2Q0GNC1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Inf2Q0GNC1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Inf2Q0GNC1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Inf2Q0GNC1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Inf2Q0GNC1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Inf2Q0GNC1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Inf2Q0GNC1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Inf2Q0GNC1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Inf2Q0GNC1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Inf2Q0GNC1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Inf2Q0GNC1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Inf2Q0GNC1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Inf2Q0GNC1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Inf2Q0GNC1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Inf2Q0GNC1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Inf2Q0GNC1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Inf2Q0GNC1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms