Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC1

Parva, Alpha-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvaQ9EPC1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,94■■■■□ 3,66
ParvaQ9EPC1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
ParvaQ9EPC1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
ParvaQ9EPC1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,17
ParvaQ9EPC1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
ParvaQ9EPC1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
ParvaQ9EPC1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,81■■■■□ 3
ParvaQ9EPC1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
ParvaQ9EPC1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
ParvaQ9EPC1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
ParvaQ9EPC1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
ParvaQ9EPC1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
ParvaQ9EPC1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,73■■■□□ 2,83
ParvaQ9EPC1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
ParvaQ9EPC1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
ParvaQ9EPC1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
ParvaQ9EPC1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
ParvaQ9EPC1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
ParvaQ9EPC1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
ParvaQ9EPC1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
ParvaQ9EPC1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
ParvaQ9EPC1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
ParvaQ9EPC1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
ParvaQ9EPC1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
ParvaQ9EPC1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
ParvaQ9EPC1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,86■■■□□ 2,69
ParvaQ9EPC1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
ParvaQ9EPC1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,79■■■□□ 2,68
ParvaQ9EPC1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
ParvaQ9EPC1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
ParvaQ9EPC1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
ParvaQ9EPC1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
ParvaQ9EPC1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,65
ParvaQ9EPC1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,55■■■□□ 2,64
ParvaQ9EPC1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
ParvaQ9EPC1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
ParvaQ9EPC1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
ParvaQ9EPC1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
ParvaQ9EPC1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
ParvaQ9EPC1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,1■■■□□ 2,57
ParvaQ9EPC1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
ParvaQ9EPC1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,56
ParvaQ9EPC1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
ParvaQ9EPC1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
ParvaQ9EPC1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
ParvaQ9EPC1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
ParvaQ9EPC1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
ParvaQ9EPC1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
ParvaQ9EPC1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
ParvaQ9EPC1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,53■■■□□ 2,48
ParvaQ9EPC1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
ParvaQ9EPC1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
ParvaQ9EPC1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
ParvaQ9EPC1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
ParvaQ9EPC1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
ParvaQ9EPC1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
ParvaQ9EPC1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,07■■■□□ 2,4
ParvaQ9EPC1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
ParvaQ9EPC1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
ParvaQ9EPC1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,93■■■□□ 2,38
ParvaQ9EPC1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
ParvaQ9EPC1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
ParvaQ9EPC1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
ParvaQ9EPC1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
ParvaQ9EPC1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
ParvaQ9EPC1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
ParvaQ9EPC1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
ParvaQ9EPC1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
ParvaQ9EPC1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
ParvaQ9EPC1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
ParvaQ9EPC1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
ParvaQ9EPC1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
ParvaQ9EPC1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,66■■■□□ 2,34
ParvaQ9EPC1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
ParvaQ9EPC1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
ParvaQ9EPC1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
ParvaQ9EPC1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
ParvaQ9EPC1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
ParvaQ9EPC1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
ParvaQ9EPC1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,48■■■□□ 2,31
ParvaQ9EPC1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
ParvaQ9EPC1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
ParvaQ9EPC1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
ParvaQ9EPC1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
ParvaQ9EPC1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
ParvaQ9EPC1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
ParvaQ9EPC1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
ParvaQ9EPC1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
ParvaQ9EPC1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,23■■■□□ 2,27
ParvaQ9EPC1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
ParvaQ9EPC1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
ParvaQ9EPC1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
ParvaQ9EPC1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
ParvaQ9EPC1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
ParvaQ9EPC1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
ParvaQ9EPC1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
ParvaQ9EPC1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
ParvaQ9EPC1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
ParvaQ9EPC1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
ParvaQ9EPC1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms