Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,87■■■■□ 3,65
Rwdd4Q9CPR1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Rwdd4Q9CPR1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Rwdd4Q9CPR1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Rwdd4Q9CPR1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Rwdd4Q9CPR1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Rwdd4Q9CPR1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Rwdd4Q9CPR1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
Rwdd4Q9CPR1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Rwdd4Q9CPR1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Rwdd4Q9CPR1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Rwdd4Q9CPR1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Rwdd4Q9CPR1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Rwdd4Q9CPR1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Rwdd4Q9CPR1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Rwdd4Q9CPR1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Rwdd4Q9CPR1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,69■■■□□ 2,66
Rwdd4Q9CPR1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Rwdd4Q9CPR1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Rwdd4Q9CPR1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Rwdd4Q9CPR1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Rwdd4Q9CPR1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Rwdd4Q9CPR1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Rwdd4Q9CPR1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Rwdd4Q9CPR1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Rwdd4Q9CPR1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Rwdd4Q9CPR1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Rwdd4Q9CPR1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Rwdd4Q9CPR1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Rwdd4Q9CPR1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Rwdd4Q9CPR1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Rwdd4Q9CPR1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Rwdd4Q9CPR1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Rwdd4Q9CPR1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rwdd4Q9CPR1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rwdd4Q9CPR1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Rwdd4Q9CPR1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Rwdd4Q9CPR1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Rwdd4Q9CPR1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Rwdd4Q9CPR1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Rwdd4Q9CPR1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Rwdd4Q9CPR1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Rwdd4Q9CPR1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Rwdd4Q9CPR1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Rwdd4Q9CPR1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rwdd4Q9CPR1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rwdd4Q9CPR1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rwdd4Q9CPR1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rwdd4Q9CPR1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Rwdd4Q9CPR1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Rwdd4Q9CPR1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Rwdd4Q9CPR1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Rwdd4Q9CPR1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rwdd4Q9CPR1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rwdd4Q9CPR1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Rwdd4Q9CPR1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Rwdd4Q9CPR1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rwdd4Q9CPR1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rwdd4Q9CPR1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rwdd4Q9CPR1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Rwdd4Q9CPR1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Rwdd4Q9CPR1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rwdd4Q9CPR1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rwdd4Q9CPR1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rwdd4Q9CPR1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rwdd4Q9CPR1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Rwdd4Q9CPR1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Rwdd4Q9CPR1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rwdd4Q9CPR1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rwdd4Q9CPR1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rwdd4Q9CPR1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rwdd4Q9CPR1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Rwdd4Q9CPR1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Rwdd4Q9CPR1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rwdd4Q9CPR1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rwdd4Q9CPR1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rwdd4Q9CPR1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Rwdd4Q9CPR1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Rwdd4Q9CPR1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rwdd4Q9CPR1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Rwdd4Q9CPR1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rwdd4Q9CPR1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rwdd4Q9CPR1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rwdd4Q9CPR1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rwdd4Q9CPR1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rwdd4Q9CPR1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Rwdd4Q9CPR1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rwdd4Q9CPR1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rwdd4Q9CPR1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Rwdd4Q9CPR1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rwdd4Q9CPR1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rwdd4Q9CPR1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Rwdd4Q9CPR1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rwdd4Q9CPR1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rwdd4Q9CPR1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rwdd4Q9CPR1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rwdd4Q9CPR1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rwdd4Q9CPR1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Rwdd4Q9CPR1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rwdd4Q9CPR1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
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