RNA–Protein interactions for RNA: YPL179W

PPQ1, Transcript of Protein phosphatase that regulates the mating response, yeast

Gene PPQ1, Length 1,650 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPQ1	YPL179W	YGR035C	P53222	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YML083C	Q04526	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	HPF1	Q05164	967 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	COB	P00163	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	PRD1	P25375	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YKR075C	P36155	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YTA6	P40328	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	THI22	Q06490	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	NUP145	P49687	1317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	MLF3	P32047	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	ALD2	P47771	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	SRS2	P12954	1174 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	JJJ3	P47138	172 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	IOC4	Q04213	475 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PPQ1	YPL179W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	CEM1	P39525	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	NPR2	P39923	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	RTT109	Q07794	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	RGP1	P16664	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	TRK2	P28584	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	MEC3	Q02574	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	MRPL16	P38064	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	SPR3	P41901	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	SAP155	P43612	1002 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	SKP1	P52286	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	PUN1	Q06991	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	KAP122	P32767	1081 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	YBR197C	P38306	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	AOS1	Q06624	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	MRPL33	P20084	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	YNL050C	P53952	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	ATG13	Q06628	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	ALE1	Q08548	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	RPC31	P17890	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	CTF4	Q01454	927 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	STB3	Q12427	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	FPS1	P23900	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	YBR287W	P38355	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	RRT14	P40470	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	PNP1	Q05788	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	COQ4	O13525	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	KCC4	P25389	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	VMA3	P25515	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	CTH1	P47976	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	MTO1	P53070	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	YBP2	P53169	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPQ1	YPL179W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	HEH2	Q03281	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	CDC45	Q08032	650 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	ISC10	P32645	267 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	RRN6	P32786	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	MSC7	P38694	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	DYS1	P38791	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	QDR2	P40474	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	YJL181W	P46987	611 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	GYP7	P48365	746 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	ZDS2	P54786	942 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	APC11	Q12157	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	EDE1	P34216	1381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	GEF1	P37020	779 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	SRT1	Q03175	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	LDH1	P38139	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	APM2	P38700	605 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	MAM1	P40065	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	RMT2	Q03305	412 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	LYS2	P07702	1392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	RAD4	P14736	754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPQ1	YPL179W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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