RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 KDM5BQ9UGL1 1544 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRB-210ENST00000551525 CEP170Q5SW79 1584 aa7.59□□□□□ -1.19
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PTPRB-210ENST00000551525 ZPR1O75312 459 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 SATB1Q01826 763 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 AK7Q96M32 723 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA1LP34931 641 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 PAF1Q8N7H5 531 aa7.52□□□□□ -1.21
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