RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 USP35Q9P2H5 1018 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 ABCC6O95255 1503 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC7Q96M83 1385 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 COL18A1P39060 1754 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-215ENST00000514625 AMPHP49418 695 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 CRB1P82279 1406 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.56■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 IP6K1Q92551 441 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.55■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 LTN1O94822 1766 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 FBLN1P23142 703 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 BARGINQ6ZT62 677 aa24.54■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 NSD2O96028 1365 aa24.52■■□□□ 1.52
FAAP20-215ENST00000514625 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.51■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 HOXC9P31274 260 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 ERBB3P21860 1342 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 RTL1A6NKG5 1358 aa24.5■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 RGPD5Q99666 1765 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.49■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 MORC1Q86VD1 984 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-215ENST00000514625 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 FLT4P35916 1363 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 PDE3BQ13370 1112 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 INSRP06213 1382 aa24.41■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 POLKQ9UBT6 870 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-215ENST00000514625 DDB1Q16531 1140 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC125Q86Z20 511 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 IL2RBP14784 551 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 PEAK1Q9H792 1746 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 EXOC5O00471 708 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 FAM182BQ5T319 152 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 DISP2A7MBM2 1401 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-215ENST00000514625 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF4Q96M43 638 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC37A3O60309 1634 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.28■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 TNS2Q63HR2 1409 aa24.27■■□□□ 1.48
FAAP20-215ENST00000514625 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 EP400Q96L91 3159 aa24.26■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 MTHFSP49914 203 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.24■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM37O94972 964 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 EYA1Q99502 592 aa24.23■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 BAG6P46379 1132 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-215ENST00000514625 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 MEGF6O75095 1541 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 BCL9O00512 1426 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 NCAPD2Q15021 1401 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 APBA3O96018 575 aa24.16■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.15■■□□□ 1.46
FAAP20-215ENST00000514625 IL13P35225 146 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms