RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505685.1

ZBED3-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ZBED3, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-202ENST00000505685 ABCC6O95255 1503 aa12.86□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 NFAT5O94916 1531 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 STRN4Q9NRL3 753 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 RGS12O14924 1447 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 NSD3Q9BZ95 1437 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa12.85□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.84□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 SOX12O15370 315 aa12.84□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 PANK3Q9H999 370 aa12.84□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 KIF7Q2M1P5 1343 aa12.84□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa12.83□□□□□ -0.35
ZBED3-202ENST00000505685 NRAPQ86VF7 1730 aa12.83□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 BARGINQ6ZT62 677 aa12.83□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 SEPT12Q8IYM1 358 aa12.83□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.83□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 MYOM1P52179 1685 aa12.83□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.83□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 IP6K1Q92551 441 aa12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 KNSTRNQ9Y448 316 aa12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.82□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 NSD2O96028 1365 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 GLI3P10071 1580 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 CRB1P82279 1406 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 RTL1A6NKG5 1358 aa12.81□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 A0A0G2JS52 829 aa12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 AMPHP49418 695 aa12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 MYT1Q01538 1121 aa12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 CARD10Q9BWT7 1032 aa12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 CCDC7Q96M83 1385 aa12.8□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 KRT27Q7Z3Y8 459 aa12.79□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 ERBB3P21860 1342 aa12.79□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.79□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 COL18A1P39060 1754 aa12.79□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 CCDC125Q86Z20 511 aa12.78□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 USP35Q9P2H5 1018 aa12.78□□□□□ -0.36
ZBED3-202ENST00000505685 HOXC9P31274 260 aa12.77□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.77□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.76□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 FLT4P35916 1363 aa12.76□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.76□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 EP400Q96L91 3159 aa12.75□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 PDE3BQ13370 1112 aa12.75□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.75□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.74□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 MORC1Q86VD1 984 aa12.74□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.73□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 INSRP06213 1382 aa12.73□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 FAM196AQ6ZSG2 479 aa12.73□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 LTN1O94822 1766 aa12.73□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 FBLN1P23142 703 aa12.72□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 DDB1Q16531 1140 aa12.72□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 EXOC5O00471 708 aa12.71□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 IL2RBP14784 551 aa12.71□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 POLKQ9UBT6 870 aa12.71□□□□□ -0.37
ZBED3-202ENST00000505685 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.7□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.7□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 DISP2A7MBM2 1401 aa12.7□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 RGPD5Q99666 1765 aa12.69□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.68□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.68□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 ZBTB22O15209 634 aa12.67□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 NBPF6Q5VWK0 638 aa12.67□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 NBPF4Q96M43 638 aa12.67□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 BCL9O00512 1426 aa12.67□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.66□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.66□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 TNS2Q63HR2 1409 aa12.65□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 BAG6P46379 1132 aa12.65□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.65□□□□□ -0.38
ZBED3-202ENST00000505685 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
ZBED3-202ENST00000505685 PEAK1Q9H792 1746 aa12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms