RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 STRN4Q9NRL3 753 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 PLCH1Q4KWH8 1693 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 RTL1A6NKG5 1358 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR17Q8IZU2 1322 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 LMO7Q8WWI1 1683 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP2-208ENST00000504294 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP2-208ENST00000504294 AXIN2Q9Y2T1 843 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP2-208ENST00000504294 FLT4P35916 1363 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-208ENST00000504294 NRAPQ86VF7 1730 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 ERBB3P21860 1342 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP2-208ENST00000504294 INSRP06213 1382 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 COL18A1P39060 1754 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
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SH3BP2-208ENST00000504294 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 POLKQ9UBT6 870 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 SEPT12Q8IYM1 358 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 USP35Q9P2H5 1018 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-208ENST00000504294 LTN1O94822 1766 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-208ENST00000504294 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-208ENST00000504294 GLI3P10071 1580 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-208ENST00000504294 RGS12O14924 1447 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-208ENST00000504294 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-208ENST00000504294 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.68■□□□□ 0.74
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SH3BP2-208ENST00000504294 DDB1Q16531 1140 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP53Q96M91 514 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC125Q86Z20 511 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 MTHFSP49914 203 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 RALBP1Q15311 655 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 RGPD5Q99666 1765 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM196AQ6ZSG2 479 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.58■□□□□ 0.73
SH3BP2-208ENST00000504294 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 NBPF6Q5VWK0 638 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 NBPF4Q96M43 638 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDCQ9Y266 331 aa19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP2-208ENST00000504294 EYA1Q99502 592 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 PEAK1Q9H792 1746 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP2R1AP30153 589 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 SPG7Q9UQ90 795 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 IGSF1Q8N6C5 1336 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 IL13P35225 146 aa19.52■□□□□ 0.72
SH3BP2-208ENST00000504294 TNS2Q63HR2 1409 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 NCAPD2Q15021 1401 aa19.51■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL9O00512 1426 aa19.5■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 USHBP1Q8N6Y0 703 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.49■□□□□ 0.71
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