RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1-204ENST00000442563 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1-204ENST00000442563 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCC6O95255 1503 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1-204ENST00000442563 COL18A1P39060 1754 aa23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC7Q96M83 1385 aa23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 BARGINQ6ZT62 677 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 IP6K1Q92551 441 aa23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 CRB1P82279 1406 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 FBLN1P23142 703 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1-204ENST00000442563 USP35Q9P2H5 1018 aa23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 NSD2O96028 1365 aa23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 AMPHP49418 695 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 ERBB3P21860 1342 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXC9P31274 260 aa23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0G2JS52 829 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 MYT1Q01538 1121 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 RTL1A6NKG5 1358 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 LTN1O94822 1766 aa23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1-204ENST00000442563 RGPD5Q99666 1765 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FLT4P35916 1363 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 MORC1Q86VD1 984 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 POLKQ9UBT6 870 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 INSRP06213 1382 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC125Q86Z20 511 aa23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE3BQ13370 1112 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 DISP2A7MBM2 1401 aa22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 DDB1Q16531 1140 aa22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 EXOC5O00471 708 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 IL2RBP14784 551 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.96■■□□□ 1.27
RABGEF1-204ENST00000442563 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 NBPF4Q96M43 638 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 PEAK1Q9H792 1746 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM182BQ5T319 152 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC37A3O60309 1634 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 MTHFSP49914 203 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 EYA1Q99502 592 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 BCL9O00512 1426 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TNS2Q63HR2 1409 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 NCAPD2Q15021 1401 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM37O94972 964 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1-204ENST00000442563 EP400Q96L91 3159 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 IL13P35225 146 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 MEGF6O75095 1541 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 BAG6P46379 1132 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RABGEF1-204ENST00000442563 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.245e-7■□□□□ 11.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms