RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.59■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0232Q92628 1395 aa22.59■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.58■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSPA1LP34931 641 aa22.57■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.54■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHPRHQ149N8 1683 aa22.53■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCA3Q99758 1704 aa22.53■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHRNA2Q15822 529 aa22.52■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.52■■□□□ 1.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCHSD2O94868 740 aa22.51■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTN1O94822 1766 aa22.51■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.5■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM83GA6ND36 823 aa22.5■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERBB3P21860 1342 aa22.49■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.49■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 EYA1Q99502 592 aa22.48■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO41Q8TF61 875 aa22.47■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 RUNDC1Q96C34 613 aa22.47■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.46■■□□□ 1.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDRP35968 1356 aa22.45■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTS2O95450 1211 aa22.45■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.45■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL18A1P39060 1754 aa22.45■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMOX1P09601 288 aa22.44■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.44■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.44■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEFMP07197 916 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBPF4Q96M43 638 aa22.43■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.42■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKAR2BP31323 418 aa22.42■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTG4Q9NY30 223 aa22.42■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.42■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 EVA1CP58658 441 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NGEFQ8N5V2 710 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCAPD2Q15021 1401 aa22.41■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.4■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.4■■□□□ 1.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 APAF1O14727 1248 aa22.38■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.38■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.37■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.37■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 STRN4Q9NRL3 753 aa22.37■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRP6O75581 1613 aa22.37■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLIT2O94813 1529 aa22.36■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.36■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.35■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 NGLY1Q96IV0 654 aa22.35■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 C8orf37Q96NL8 207 aa22.35■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.35■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRB1P82279 1406 aa22.34■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.34■■□□□ 1.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.32■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFE2L2Q16236 605 aa22.31■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC27Q2M243 656 aa22.3■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.3■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.29■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.29■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGPD5Q99666 1765 aa22.28■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.28■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIPK4P57078 832 aa22.27■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.27■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.27■■□□□ 1.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.26■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.26■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEUROD2Q15784 382 aa22.26■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP21Q9UK80 565 aa22.25■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL2RBP14784 551 aa22.25■■□□□ 1.15
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