RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STRN4Q9NRL3 753 aa20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.93■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IP6K1Q92551 441 aa20.92■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.92■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.92■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTL1A6NKG5 1358 aa20.92■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.91■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.9■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.9■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.9■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMPHP49418 695 aa20.9■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.89■□□□□ 0.94
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERBB3P21860 1342 aa20.88■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRB1P82279 1406 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXC9P31274 260 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BARGINQ6ZT62 677 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MORC1Q86VD1 984 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS12O14924 1447 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRAPQ86VF7 1730 aa20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FLT4P35916 1363 aa20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBLN1P23142 703 aa20.84■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.84■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.83■□□□□ 0.93
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLI3P10071 1580 aa20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INSRP06213 1382 aa20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLKQ9UBT6 870 aa20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP35Q9P2H5 1018 aa20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL18A1P39060 1754 aa20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0G2JS52 829 aa20.78■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SOCS7O14512 581 aa20.78■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYT1Q01538 1121 aa20.78■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.78■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.74■□□□□ 0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DISP2A7MBM2 1401 aa20.72■□□□□ 0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL2RBP14784 551 aa20.71■□□□□ 0.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE3BQ13370 1112 aa20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDB1Q16531 1140 aa20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF4Q96M43 638 aa20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.7■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTHFSP49914 203 aa20.69■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LTN1O94822 1766 aa20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOC5O00471 708 aa20.67■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEAK1Q9H792 1746 aa20.67■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCAPD2Q15021 1401 aa20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC125Q86Z20 511 aa20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.65■□□□□ 0.9
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RALBP1Q15311 655 aa20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EYA1Q99502 592 aa20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNS2Q63HR2 1409 aa20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP2R1AP30153 589 aa20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFAP53Q96M91 514 aa20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL13P35225 146 aa20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCL9O00512 1426 aa20.61■□□□□ 0.89
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