RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kif23E9Q5G3 953 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bsdc1Q80Y55 427 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trpc5Q9QX29 975 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam184bQ0KK56 942 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgap33Q80YF9 1305 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Akap11E9Q777 1895 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AtrnQ9WU60 1428 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pak3Q61036 559 aa15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ginm1Q91WR6 327 aa15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 TnrQ8BYI9 1358 aa15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Q8BT18 775 aa15.77■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Egfem1Q8C088 590 aa15.77■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Exoc5Q3TPX4 708 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hirip3Q8BLH7 601 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kcnh5Q920E3 988 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rad23bP54728 416 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sik1Q60670 779 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ciz1Q8VEH2 845 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf335A2A5K6 1337 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 FanciQ8K368 1330 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nsd3Q6P2L6 1439 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pnpla7A2AJ88 1352 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mst1rQ62190 1378 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zbtb4Q5F293 982 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sgip1Q8VD37 806 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Akt1s1Q9D1F4 257 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dennd6aQ8BH65 605 aa15.73■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fmnl2A2APV2 1086 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fchsd2Q3USJ8 740 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 TatQ8QZR1 454 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nlgn1Q99K10 843 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ankrd13dQ6PD24 605 aa15.71■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 FancaQ9JL70 1439 aa15.7■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kif16bB1AVY7 1312 aa15.7■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Stard8Q8K031 1019 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Emilin1Q99K41 1017 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 IncenpQ9WU62 880 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam198bQ3UPI1 517 aa15.68■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Neurod1Q60867 357 aa15.68■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zpr1Q62384 459 aa15.68■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cabp4Q8VHC5 271 aa15.68■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CrklP47941 303 aa15.68■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 OptnQ8K3K8 584 aa15.67■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Srcin1Q9QWI6 1250 aa15.67■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ptpn23Q6PB44 1692 aa15.66■□□□□ 0.1
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plekhd1B2RPU2 505 aa15.64■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eid3Q3V124 375 aa15.64■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppm1fQ8CGA0 452 aa15.64■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kcnh4A2A5F7 1018 aa15.63■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rimbp2Q80U40 1072 aa15.63■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slit1Q80TR4 1531 aa15.63■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sos2Q02384 1333 aa15.62■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Magea6O89010 325 aa15.61■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gpr162Q3UN16 588 aa15.61■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Magea3Q6T340 320 aa15.61■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa15.61■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cnga1P29974 684 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem132eQ6IEE6 982 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam122aQ9DB52 284 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zranb3Q6NZP1 1069 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Usp21Q9QZL6 566 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ErfeQ6PGN1 340 aa15.59■□□□□ 0.09
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ano8Q6PB70 1060 aa15.58■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Socs7Q8VHQ2 579 aa15.57■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 InsrP15208 1372 aa15.56■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa15.55■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kcnn1Q9EQR3 537 aa15.55■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa15.54■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arfgef2A2A5R2 1792 aa15.54■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa15.53■□□□□ 0.08
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Jdp2P97875 163 aa15.51■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Adgre1Q61549 931 aa15.51■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 TkfcQ8VC30 578 aa15.51■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 FocadA2AKG8 1798 aa15.5■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Col15a1O35206 1367 aa15.5■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MeiocA2AG06 965 aa15.5■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Msl1Q6PDM1 616 aa15.5■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa15.5■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa15.49■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam50bQ9WTJ8 334 aa15.49■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CemipQ8BI06 1361 aa15.48■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Igsf1Q7TQA1 1317 aa15.48■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa15.48■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm10471E9Q1C7 252 aa15.47■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prom2Q3UUY6 835 aa15.47■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Col23a1Q8K4G2 532 aa15.47■□□□□ 0.07
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hoxc9P09633 260 aa15.45■□□□□ 0.06
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Klc3Q91W40 508 aa15.45■□□□□ 0.06
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ubr1O70481 1757 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms