RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zeb2Q9R0G7 1215 aa29.16■■■□□ 2.26
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Map2P20357 1828 aa29.12■■■□□ 2.25
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trim28Q62318 834 aa28.73■■■□□ 2.19
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif23E9Q5G3 953 aa28.72■■■□□ 2.19
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zranb3Q6NZP1 1069 aa28.72■■■□□ 2.19
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trpc5Q9QX29 975 aa28.71■■■□□ 2.19
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mst1rQ62190 1378 aa28.66■■■□□ 2.18
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Egfem1Q8C088 590 aa28.64■■■□□ 2.18
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pnpla7A2AJ88 1352 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Hirip3Q8BLH7 601 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Zfp777B9EKF4 885 aa28.62■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rad23bP54728 416 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rsph6aQ8CDR2 708 aa28.61■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Eya1P97767 591 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Akt1s1Q9D1F4 257 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Simc1E9Q6E9 1354 aa28.6■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa28.59■■■□□ 2.17
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.59■■■□□ 2.17
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